原核生物的转录过程可分为转录起始、转录延长和转录终止三个阶段。
一、转录起始需要RNA聚合酶全酶
转录起始过程:
1.RNA聚合酶全酶(a2bb¢s)识别并结合启动子,形成闭合转录复合体(closed transcription comple);
2. DNA双链打开,形成开放转录复合体(open transcription complex) ;DNA分子接近-10区域的部分双螺旋解开后转录开始。DNA双链解开的范围只在17 bp左右,这比复制中形成的复制叉小得多。
3. 在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成第一个磷酸二酯键:

5¢-pppG -OH + NTP ® 5¢-pppGpN - OH 3¢ + ppi
第一个磷酸二酯键生成后,转录复合体的构象发生改变,σ亚基即从转录起始复合物上脱落,核心酶连同四磷酸二核苷酸,继续结合于DNA模板上,酶沿DNA链前移,进入延长阶段。
二、RNA pol核心酶独立延长RNA链
1. s亚基脱落,RNA–pol聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着DNA模板前移;
2. 在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链不断延长。
(NMP)n + NTP¾® (NMP) n+1 + PPi
转录延长以下特点
① 核心酶负责RNA链延长反应;
② RNA链从5¢-端向3¢-端延长,新的核苷酸都是加到3¢-OH上;
③对DNA模板链的阅读方向是3¢-端向5¢-端,合成的RNA链与之呈反向互补,即酶是沿着模板链的3¢向5¢方向或沿着编码链的5¢向3¢方向前进的;
④ 合成区域存在着动态变化的8 bp 的RNA-DNA杂合双链;
⑤ 模板DNA的双螺旋结构随着核心酶的移动发生解链和再复合的动态变化。
三、原核生物转录延长与蛋白质的翻译同时进行

四、原核生物转录终止分为依赖r因子与非依赖r因子两大类
(一)依赖r因子的转录终止
r因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量46kD。
r因子能结合RNA,又以对polyC的结合力最强,但对poly dC/dG组成的DNA的结合能力就低得多。
r因子还有ATP酶活性和解螺旋酶(helicase)的活性。
(二)非依赖 r因子的转录终止
DNA模板上靠近终止处,有些特殊的碱基序列,转录出RNA后,RNA产物形成特殊的结构来终止转录。
茎环结构使转录终止的机制
使RNA聚合酶变构,转录停顿;
局部RNA/DNA杂化短链的碱基配对是最不稳定的。RNA链上的多聚U也是促使RNA链从模板上脱落的重要因素。

