核酸酶是指所有可以水解核酸的酶。

依据底物不同分类

DNA酶(deoxyribonuclease, DNase)：专一降解DNA。

RNA酶(ribonuclease, RNase)：专一降解RNA。

依据对底物作用方式不同

核酸内切酶：在DNA或RNA分子内部切断磷酸二酯键。

核酸外切酶：水解核酸分子链末端的磷酸二酯键。有5´→3´或3´→5´核酸外切酶。

核酸酶的功能

参与DNA的合成、修复以及RNA的剪接。

清除多余的、结构和功能异常的核酸，以及侵入细胞的外源性核酸。

降解食物中的核酸。

体外重组DNA技术中的重要工具酶。