一、真核细胞基因表达的特点

① 真核基因组比原核基因组大得多

② 原核基因组的大部分序列都为编码基因，而哺乳类基因组中只有10%的序列编码蛋白质、rRNA、tRNA等，其余90%的序列，包括大量的重复序列功能至今还不清楚，可能参与调控

③ 真核生物编码蛋白质的基因是不连续的，转录后需要剪接去除内含子，这就增加了基因表达调控的层次 

④原核生物的基因编码序列在操纵子中，多顺反子mRNA使得几个功能相关的基因自然协调控制；而真核生物则是一个结构基因转录生成一条mRNA，即mRNA是单顺反子（monocistron），许多功能相关的蛋白、即使是一种蛋白的不同亚基也将涉及到多个基因的协调表达

⑤ 真核生物DNA在细胞核内与多种蛋白质结合构成染色质，这种复杂的结构直接影响着基因表达；

⑥ 真核生物的遗传信息不仅存在于核DNA上，还存在线粒体DNA上，核内基因与线粒体基因的表达调控既相互独立而又需要协调。

二、染色质结构与真核基因表达密切相关

（一）转录活化的染色质对核酸酶极为敏感

（二）转录活化染色质的组蛋白发生改变

组蛋白修饰对于基因表达影响的机制也包括两种相互包容的理论。即：组蛋白的修饰直接影响染色质或核小体的结构，以及化学修饰征集了其他调控基因转录的蛋白质，为其他功能分子与组蛋白结合搭建了一个平台。这些理论构成了“组蛋白密码”的假说。

（三）CpG岛甲基化水平降低

CpG岛（CpG island)：甲基化胞嘧啶在基因组中并不是均匀分布，有些成簇的非甲基化CG存在于整个基因组中，人们将这些GC含量可达60%，长度为300-3000bp的区段

表观遗传（epigenetic  inheritance)：染色质结构对基因表达的影响可以遗传给子代细胞，其机制是细胞内存在着具有维持甲基化作用的DNA甲基转移酶，可以在DNA复制后，依照亲本DNA链的甲基化位置催化子链DNA在相同位置上发生甲基化

三、基因组中的顺式作用元件是转录起始的关键调节部位

（一）真核生物启动子结构和调节远较原核生物复杂

（二）增强子是能够提高转录效率的顺式调控元件

（三）沉默子能够抑制基因的转录

四、转录因子是转录调控的关键分子

由某一基因表达产生的蛋白质因子，通过与另一基因的特异的顺式作用元件相互作用，调节其表达。这种调节作用称为反式作用。

还有蛋白质因子可特异识别、结合自身基因的调节序列，调节自身基因的表达，称顺式作用。

1.转录调节因子分类（按功能特性）

通用转录因子(generaltranscription factors)

是RNA聚合酶结合启动子所必需的一组蛋白因子，决定三种RNA(mRNA、tRNA及rRNA)转录的类别。

特异转录因子(specialtranscription factors)

为个别基因转录所必需，决定该基因的时间、空间特异性表达。

2.转录调节因子结构

锌指模体(zincfinger)

常结合GC盒

碱性螺旋-环-螺旋（basic helix-loop-helix,bHLH)

常结合CAAT盒

碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper, Bzip)

常结合CAAT盒

五、转录起始复合物的动态构成是转录调控的主要方式

（一）启动序列/启动子与RNA聚合酶活性