Training Courses of iGEM（Internat...

徐浩

目录

  • 1 Course Sections
    • 1.1 Brief Introduction to iGEM competition
      • 1.1.1 Brief Introduction of Synthetic Biology
      • 1.1.2 Brief Introduction of iGEM
    • 1.2 AHUT_iGEM 2016
      • 1.2.1 Brief Introduction of Project
    • 1.3 AHUT_iGEM 2015
      • 1.3.1 Brief Introduction of Project
      • 1.3.2 比赛花絮
    • 1.4 AHUT_iGEM 2014
      • 1.4.1 比赛花絮
    • 1.5 AHUT_iGEM 2013
      • 1.5.1 比赛花絮
    • 1.6 Assignments of the Section
    • 1.7 We Want You！
      • 1.7.1 AHUT_China2017年招新计划
      • 1.7.2 AHUT_China优秀队友简介
  • 2 Modern Molecular Biology
    • 2.1 Basics of Modern Molecular Biology
    • 2.2 Key Experiments
      • 2.2.1 限制性内切核酸酶及限制性内切核酸酶消化DNA实验
      • 2.2.2 电泳技术以及琼脂糖凝胶电泳
      • 2.2.3 PCR基本操作
      • 2.2.4 DNA重组
      • 2.2.5 感受态细胞的制备
    • 2.3 Assignments of the Section
  • 3 Synthetic Biology
    • 3.1 Overview of Synthetic Biology
      • 3.1.1 合成生物学的诞生
      • 3.1.2 合成生物学的研究内容
      • 3.1.3 合成生物学的意义
      • 3.1.4 合成生物学工程本质
      • 3.1.5 合成生物学与相关学科
    • 3.2 Design of Synthetic Biology System
      • 3.2.1 标准化生物模块
      • 3.2.2 BioBrick命名规则
      • 3.2.3 BioBrick的连接
    • 3.3 Mathematical Modeling and Performance Analysis
    • 3.4 Frontiers of Synthetic Biology
      • 3.4.1 合成生物学研究方向
      • 3.4.2 新的研究成果
  • 4 Bioinformatics
    • 4.1 Summarization
    • 4.2 Brief Introduction to Bioinformatics
    • 4.3 Definition of Bioinformatics
    • 4.4 Phases Division of Bioinformatics
      • 4.4.1 前基因组时代
      • 4.4.2 基因组时代
      • 4.4.3 后基因组时代
    • 4.5 Development of Bioinformatics
    • 4.6 Research Direction of Bioinformatics
      • 4.6.1 序列比对
      • 4.6.2 蛋白质比对
      • 4.6.3 基因识别分析
      • 4.6.4 分子进化
      • 4.6.5 序列重叠群（Contigs）装配
      • 4.6.6 遗传密码
      • 4.6.7 药物设计
      • 4.6.8 生物系统
      • 4.6.9 技术方法
      • 4.6.10 生物图像
      • 4.6.11 其他
    • 4.7 Research Methods of Bioinformatics
    • 4.8 Mathematical Issues of Bioinformatics
      • 4.8.1 统计学的悖论
      • 4.8.2 度量空间的假设
    • 4.9 Assignment of the Section
  • 5 Current Protocols
    • 5.1 Basics of Biology Safety and Protection
      • 5.1.1 生物安全防护相关概念
      • 5.1.2 生物安全防护
    • 5.2 120 Toxic Substances in Biology Lab
    • 5.3 Safe Operations in Biology Lab
      • 5.3.1 标本容器的相关操作
      • 5.3.2 移液管和移液辅助器的使用
      • 5.3.3 避免感染性物质的扩散
      • 5.3.4 生物安全柜的使用
      • 5.3.5 避免感染性物质的食入以及与皮肤和眼睛的接触
      • 5.3.6 避免感染性物质的注入
      • 5.3.7 离心机的使用
      • 5.3.8 匀浆器、摇床、搅拌器和超声处理器的使用
      • 5.3.9 组织研磨器的使用
      • 5.3.10 冰箱与冰柜和培养箱的维护和使用
      • 5.3.11 标本的收集、标记和运输
      • 5.3.12 打开标本管和取样
      • 5.3.13 玻璃器皿和“锐器”
      • 5.3.14 用于显微镜观察的盖玻片和涂片
      • 5.3.15 自动化仪器（超声处理器、涡旋混合器）
    • 5.4 Plans and Programs of Contingency Response
      • 5.4.1 意外事故应对方案
      • 5.4.2 微生物实验室应急程序
    • 5.5 Assignment of the Section
  • 6 Wiki Web Design and Edit
    • 6.1 HTML
    • 6.2 CSS
      • 6.2.1 基础教程
      • 6.2.2 框模型
      • 6.2.3 定位
      • 6.2.4 选择器
      • 6.2.5 参考手册
        • 6.2.5.1 背景属性
        • 6.2.5.2 边框属性
        • 6.2.5.3 字体属性
        • 6.2.5.4 列表属性
        • 6.2.5.5 内(外)边距属性
        • 6.2.5.6 定位属性
        • 6.2.5.7 文本属性
        • 6.2.5.8 2D/3D转换属性
        • 6.2.5.9 过渡属性
        • 6.2.5.10 动画属性
        • 6.2.5.11 box,用户界面属性
    • 6.3 HTMLDOM
      • 6.3.1 HTML DOM 节点
      • 6.3.2 HTML方法
      • 6.3.3 HTML属性
      • 6.3.4 HTML DOM访问,修改
      • 6.3.5 HTML元素
      • 6.3.6 HTML事件
      • 6.3.7 HTML导航
      • 6.3.8 Document对象
      • 6.3.9 Anchor、Area对象
      • 6.3.10 Base、Body、Button对象
      • 6.3.11 Canvas、Event对象
      • 6.3.12 Form、Frame、Frameset对象
      • 6.3.13 IFrame、Image对象
      • 6.3.14 Button、CheckBox对象
      • 6.3.15 FileUpload、Hidden、Password对象
      • 6.3.16 Radio、Reset、Submit、Text对象
      • 6.3.17 Link、Meta、Object、Option对象
      • 6.3.18 Select、Style对象
      • 6.3.19 Table、TableCell、TableRow、Textarea对象
    • 6.4 Javascript
      • 6.4.1 使用
      • 6.4.2 输出
      • 6.4.3 语句
      • 6.4.4 注释
      • 6.4.5 变量、数据类型、对象
      • 6.4.6 函数
      • 6.4.7 运算符
      • 6.4.8 If..Else、Switch
      • 6.4.9 for、while循环
      • 6.4.10 Break、Continue
      • 6.4.11 错误Throw、Try 、 Catch
      • 6.4.12 表单验证
      • 6.4.13 对象
      • 6.4.14 Number对象
      • 6.4.15 Date对象
      • 6.4.16 Array数组对象
      • 6.4.17 Boolean逻辑对象
      • 6.4.18 Math算数对象
      • 6.4.19 RegExp对象
      • 6.4.20 Window浏览器对象
      • 6.4.21 消息框
      • 6.4.22 计时
      • 6.4.23 Cookies
    • 6.5 JQuery
      • 6.5.1 简介、安装
      • 6.5.2 语法
      • 6.5.3 选择器
      • 6.5.4 事件
      • 6.5.5 效果
      • 6.5.6 CallBack函数
      • 6.5.7 Chaining
      • 6.5.8 获得(设置)内容和属性
      • 6.5.9 添加、删除元素
      • 6.5.10 获取并设置CSS类
      • 6.5.11 CSS方法
      • 6.5.12 尺寸
      • 6.5.13 遍历
  • 7 Information of iGEM
    • 7.1 How to search data and information of iGEM?
Mathematical Issues of Bioinformatics


生物信息学中数学占了很大的比重.统计学，包括多元统计学，是生物信息学的数学基础之一；概率论与随机过程理论，如隐马尔科夫链模型（HMM），在生物信息学中有重要应用；其他如用于序列比对的运筹学；蛋白质空间结构预测和分子对接研究中采用的最优化理论；研究DNA超螺旋结构的拓扑学；研究遗传密码和DNA序列的对称性方面的群论等等.总之，各种数学理论或多或少在生物学研究中起到了相应的作用.但并非所有的数学方法在引入生物信息学中都能普遍成立的，以下以统计学和度量空间为例来说明.