一、微生物的分类

（一）通用分类单元（7级）

分类单元又称分类单位、分类阶元或分类群。种以上的系统分类单元自上而下可依次分成7级：

界Kingdom（拉：Regnum）

   门Rhylum（拉：Rhylum）或Division（拉：Divisio）

     纲Class（拉：Classis）

       目Order（拉：Ordo）

         科Family（拉：Familia）

           属Genus（拉：Genus）

             种Species（拉：Species）

当必要时，各级都可补充若干辅助单元，包括加上“亚”、“超”等，如：亚门、超纲等。

（二）分类举例

以“大肠埃希氏菌”为例：它属于细菌界（域），

朊细菌门，

发酵细菌纲，

肠杆菌目，

肠杆菌科，

埃希氏菌属，

大肠埃希氏菌（种）

（三）分类的依据

     形态特征：个体形态（形状、大小、染色反应等）、群体形态（菌落特征、液体培养特点等）                         

     生理生化特征：代谢产物、营养要求、细胞壁成分等的测定

     生态特征：微生物间各种相互关系的利用

     遗传特征：DNA同源性分析   G+C的含量

     其它：全细胞蛋白的分析、多位点酶的分析等

（四）微生物的常用分类系统

     原核生物域（古生菌、细菌、放线菌）：伯杰氏鉴定细菌学手册（前后修订出版了11个版本，被称为细菌分类学的“圣经”）

     真核生物域：Ainsworth、Smith、Alexopoulos的分类系统

二、微生物的命名

（一）俗名（common name）

优点：大众化、简明化

缺点：涵义不够确切，易重复，尤其不便于国际间的学术交流

例子：“结核杆菌”是Mycobacterium tuberculosis（结核分枝杆菌）的俗名

（二）学名（scientific name）

是某一菌种的科学名称，是按“国际命名法规”进行命名并受国际学术界公认的通用正式名称。一个微生物学或生物学工作者，必须牢记一批常用、常见的微生物学名。

物种的学名用拉丁词或拉丁化的词组成，以斜体字表示。

 

1.     双名法（常用）

属名的第一字母要大写，种名的第一字母须小写

学名=属名+种名+（首次定名人）+现定名人+现名定名年份

         

斜体字             正体字（一般省略）

 

例1：大肠埃希氏菌（简称“大肠杆菌”）

      Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919

 表示：大肠埃希氏菌是Castellani et Chalmers在1919年定名，首次定名人是Migula

例2：枯草芽孢杆菌（简称“枯草杆菌”）

     Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn 1872

 

2. 三名法（用的不多）

   当某种微生物是一个亚种（subspecies，简称“subsp”）或变种（variety，简称“var”），学名就应该按三名法拼写。

学名=属名+种名+符号subsp或var+亚种或变种

          

斜体字    正体字（可省略）斜体字（不可省略）

 

例：酿酒酵母椭圆变种（椭圆酿酒酵母）

Saccharomyces cerevisiae (var) ellipsoideus

3. 其它命名

学名=属名+种名+菌株（字母+编号）

      

斜体字       正体字

例如：Bacillussubtilis AS 1.398 枯草杆菌中能生产蛋白酶的一株菌株（“AS”是中国科学院“AcademiaSinica”的缩写）

 

（PPT上没有下面这些内容）还有一种具体到菌株的命名。菌株又称品系，表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代。同一菌种可以有许多不同菌株，它们的主要鉴定性状各个相同，但不作为鉴定用的“小”性状却可由很大差异，尤其是一些生化性状等。（好比一个家庭的兄弟姐妹，他们都是父母的孩子，遗传基因相似，是同一个“菌种”，但是他们之间又有着性格上的不同，是不同的“菌株”。）

    菌株的名称一般用字母加编号表示，其中字母表示实验室、产地或特征等的名称，编号则表示序号等数字。

4. 有关学名的其他知识

（1）属名

是一个表示该微生物主要特征的名词或用作名词的形容词，开头字母大写。其词源可来自拉丁词、希腊词或其他拉丁化的外来词。当前后有两个或更多的学名连排在一起时，若它们的属名相同，则后面的一个或几个属名可缩写成一个、两个或三个字母，在其后加上一个点。

例如：Bacillus（芽孢杆菌属）可缩写成“B．”或“Bac．”

Bacillus subtilis  [枯草（芽孢）杆菌]

B.cereus (蜡状芽孢杆菌)

B.brevis（短芽孢杆菌）

     Pseudomonas（假单胞菌属）可缩写成“P．”或“Ps．”

（2）种名

代表一个物种的次要特征。其词源也来自拉丁词、希腊词或其他拉丁化的外来词，字首一律小写。在实际工作中，经常遇到已经筛选到一株或一批有用菌种，属名很易确定，但是对具体的种不能肯定，这时种名可由“sp．”（正体，species单数的缩写）或“spp．”（正体，species复数的缩写）来表示。

例如：Bacillus sp．　表示“一种芽孢杆菌”

Bacillus spp．表示“一批芽孢杆菌”

 

三、一些最基本的微生物学名或属名

★Escherichia coli  [大肠（埃希氏）杆菌]

★Bacillus subtilis  [枯草（芽孢）杆菌]

★Staphylococcus aureus  (金黄色葡萄球菌)

★Clostridium botulinum（肉毒梭状芽孢杆菌）

★Saccharomyces cerevisiae  (酿酒酵母)

★Actinomyces（放线菌属）

★Salmonella  (沙门氏菌属)

★Lactobacillus acidophilus  (嗜酸乳杆菌)

★Shigella  (志贺氏菌属)

★Streptococcus lactis  (乳链球菌)

★Bifidobacterium（双歧杆菌属）

★Streptomyces （链霉菌属）

★Aspergillus (曲霉属)

★Penicillium chrysogenum  (产黄青霉)

★Rhizopus （根霉属）

 

Mycobacterium tuberculosis （结核分枝杆菌）

Pseudomonas aeruginosa  (铜绿假单胞菌，俗称“绿脓杆菌”)

Rhizobium  (根瘤菌属)

Spirulina (螺旋蓝细菌，俗称“螺旋藻”)

Vibrio cholerae （霍乱弧菌）

Candida utilis  (产朊假丝酵母)

Aspergillus. niger  (黑曲霉)

Neurospora crassa  (粗糙脉胞菌，俗称“红色面包霉)