医学遗传学

胡启平 等

目录

  • 1 绪论
    • 1.1 学时分配与目的要求
    • 1.2 第一节  医学遗传学的任务和范畴
    • 1.3 第二节  医学遗传学发展简史
    • 1.4 第三节 人类基因组
    • 1.5 第四节  遗传学病概述
    • 1.6 第五节 医学遗传学的发展方向(自学)
    • 1.7 章节测验
  • 2 第一章 基于疾病的遗传学数据分析(自学)
  • 3 第二章  基因突变与遗传多态性
    • 3.1 学时分配与目的要求
    • 3.2 第一节  基因突变的本质及其特性
    • 3.3 第二节  基因突变的诱发因素
    • 3.4 第三节  基因突变的形式
    • 3.5 第四节 DNA损伤的修复(自学)
    • 3.6 第五节 遗传多态性(自学)
    • 3.7 章节测验
  • 4 第三章 基因突变的细胞分子生物学效应(自学)
  • 5 第三章  染色体与减数分裂
    • 5.1 学时分配与目的要求
    • 5.2 第一节  染色质与染色体
    • 5.3 第二节  人类染色体
    • 5.4 章节测验
  • 6 第四章  染色体畸变与染色体病
    • 6.1 学时分配与目的要求
    • 6.2 第一节  染色体畸变
    • 6.3 第二节  染色体病
    • 6.4 章节测验
  • 7 第五章  孟德尔遗传与单基因遗传病
    • 7.1 学时分配与目的要求
    • 7.2 第一节  单基因遗传的基本定律及概念
    • 7.3 第二节  单基因病的基本遗传方式
    • 7.4 第三节  两种及两种以上单基因病的伴随遗传(自学)
    • 7.5 第四节  影响单基因遗传病分析的因素
    • 7.6 章节测验
  • 8 第六章  多基因遗传和多基因遗传病
    • 8.1 学时分配与目的要求
    • 8.2 第一节  多基因遗传的特点
    • 8.3 第二节  疾病的多基因遗传
    • 8.4 第三节  常见多基因病(见前述)
    • 8.5 章节测验
  • 9 第七章  线粒体遗传与线粒体遗传病(54学时要求,其余自学)
    • 9.1 学时分配与目的要求
    • 9.2 第一节 线粒体基因组
    • 9.3 第二节 线粒体基因组的遗传特征
    • 9.4 第三节 线粒体基因组突变与疾病
    • 9.5 第四节 核DNA编码的线粒体遗传病
    • 9.6 第五节 线粒体遗传病的治疗
    • 9.7 章节测验
  • 10 第八章  群体遗传
    • 10.1 学时分配与目的要求
    • 10.2 第一节 基本概念
    • 10.3 第二节  群体的遗传平衡
    • 10.4 第三节  影响遗传平衡的因素
    • 10.5 第四节  遗传负荷
    • 10.6 第五节  群体中的遗传多态现象
    • 10.7 章节测验
  • 11 第九章  分子病与先天性代谢缺陷病
    • 11.1 学时分配与目的要求
    • 11.2 第一节  分子病
    • 11.3 章节测验
  • 12 第十章  肿瘤遗传学
  • 13 第十一章  药物遗传学(54学时,其余自学)
    • 13.1 学时分配与目的要求
    • 13.2 第一节  药物反应的遗传基础
    • 13.3 第二节  药物代谢的遗传变异
    • 13.4 第三节  药物基因组学
    • 13.5 章节测验
  • 14 第十二章  免疫遗传学(自学)
  • 15 第十三章  发育遗传学与出生缺陷(自学)
  • 16 第十四章  表观遗传学(自学)
  • 17 第十五~十七章  遗传病的诊断、治疗与预防
    • 17.1 学时分配与目的要求
    • 17.2 第十五章  遗传病的诊断
      • 17.2.1 章节测验
    • 17.3 第十六章  遗传病的治疗
      • 17.3.1 章节测验
    • 17.4 第十七章  遗传病的预防
      • 17.4.1 章节测验
  • 18 实验一  人类染色体的观察
    • 18.1 学时分配与目的要求
    • 18.2 内容与步骤
    • 18.3 结果与报告
    • 18.4 思考与讨论
  • 19 实验二  人类染色体G带核型分析
    • 19.1 学时分配与目的要求
    • 19.2 内容与步骤
    • 19.3 结果与报告
    • 19.4 思考与讨论
  • 20 实验三  微核实验
    • 20.1 学时分配与目的要求
    • 20.2 内容与步骤
    • 20.3 结果与报告
    • 20.4 思考与讨论
  • 21 实验四  人外周血淋巴细胞培养及染色体标本制备(54学时,其余自学)
    • 21.1 学时分配与目的要求
    • 21.2 内容与步骤
    • 21.3 结果与报告
    • 21.4 思考与讨论
  • 22 实验五  人类染色体G显带技术及观察(54学时,其余自学)
    • 22.1 学时分配与目的要求
    • 22.2 内容与步骤
    • 22.3 结果与报告
    • 22.4 思考与讨论
第三节  影响遗传平衡的因素

第三节 影响遗传平衡的因素  

影响遗传平衡的因素主要包括:非随机婚配 (Nonrandom mating)、基因突变 (Gene mutation)、选择 (Selection)、遗传漂变 (Genetic drift)、基因流 (Gene flow)、减数驱动 (Meiotic drive)、以及遗传搭车 (Genetic draft)

 一、非随机婚配

随机婚配(Random mating)指随机选择婚配对象的婚配行为,这种选择不受表型、基因型、距离、经济条件等等各种因素的影响。非随机婚配主要包括选型婚配分层婚配近亲婚配。非随机婚配可能会降低群体杂合度,不改变基因频率。

近亲婚配 (Consanguineous mating) 指有血缘关系的个体间的婚配。近亲婚配增加了隐性基因纯合的机会,不利的隐性表型面临选择,最终将改变后代的等位基因频率。近亲的程度可用亲缘系数表示;近亲婚配使后代基因纯合的概率则用近婚系数表示。

(一)近婚系数

近婚系数coefficient of inbreeding )是指个体的一对等位基因来自祖先的同一个等位基因的概率,通常用F表示。现在能够影响近婚系数的祖先只能是父母的共同祖先。近婚系数也可以针对婚配类型来说,个体的近婚系数与父母婚配类型的近婚系数一致。这里我们以姨表兄妹婚配的例子来说明近婚系数的计算,系谱图下:

1. 常染色体遗传的近婚系数

这里要求IV1的近婚系数,则找到其父母的共同祖先I1和I2,假设他们的基因型分别为A1A2A3A4。那么,IV1要的一对等位基因都来自祖先也就是说IV1的基因型有四种可能:A1A1A2A2A3A3、A4A4

IV1基因型是A1A1的概率,也就是A1这个等位基因通过左右两边同时传下来的概率,分为如下几步:I1 → II1 → III1 → IV1、以及 I1 → II3 → III2 → IV1,这每一步传递的概率都只有1/2,A1从两边都成功从I1传到IV1的概率就是
                             [(1/2)×(1/2)×(1/2)]×[(1/2)×(1/2)×(1/2)] = (1/2)6

I1个体有两个等位基因,他对近婚系数的贡献就是2×(1/2)6,同I2个体的贡献也一样。因此IV1的近婚系数为:
                            F = 2×(1/2)+ 2×(1/2)= 1/16

很容易就能看出,个体常染色体遗传的近婚系数为其父母亲缘系数的1/2。同样,很容易就算得,对于常染色体遗传,一级亲属婚配的近婚系数为1/4,二级亲属婚配的近婚系数是1/8,三级亲属婚配的近婚系数是1/16。 

2. X连锁遗传的近婚系数

同样的例子,在X连锁遗传中,先找到共同祖先I1和I2,假设他们的基因型分别为X1Y和X2X3。那么,IV1要的一对等位基因都来自祖先也就是说IV1的基因型有三种可能:X1X1、X2X2、X3X3。不同的是,在考虑等位基因的传递的过程中,父传子和父传女的概率是不同与常染色体基因的,父传子的概率是0,而父传女的概率是1。因此,等位基因X1通过I1 → II1 → III1 → IV1及 I1 → II3 → III2 → IV1同时传到IV1的概率是
                              [(1)×(1/2)×(1)]×[(1)×(1/2)×(1/2)] = (1/2)3
等位基因X2X3通过I2 → II1 → III1 → IV1及 I2 → II3 → III2 → IV1同时传到IV1的概率是
                            [(1/2)×(1/2)×(1)]×[(1/2)×(1/2)×(1/2)] = (1/2)5
三个等位基因传递的贡献加起来就是IV1个体X连锁遗传的近婚系数:
                            F = 1×(1/2)2×(1/2)= 3/16

显然,对于X连锁遗传来说,不能简单通过亲属级别来说出近婚系数,而是需要画出系谱具体分析。而且,对于男性个体来说,不管其父母亲缘关系如何,其X连锁遗传的近婚系数肯定是0。

再看下边的两个例子:

                    

对于常染色体遗传,都是两条有5个个体的路径,近婚系数为= 1/16。对于X连锁遗传,左/上边的系谱所有路径都存在父传子(II2→III1),IV1的X连锁遗传的近婚系数为0,而对于右/下边的例子,IV1的X连锁遗传的近婚系数是 1/8。都是三级亲属婚配,X连锁近婚系数差异比较大,必须要具体问题具体分析。自己算算,看能否得到相同的结果。

在日常工作中可能会遇到比较复杂的情形,如果每次都写出每一步的概率,会比较麻烦,可以采用数个体的方法,详情见王老师网页

(二)平均近婚系数

群体的平均近婚系数 (Average Inbreeding Coefficient)是所有个体的近婚系数的平均值。评价近亲婚配对群体的危害时,除近亲婚配率外,平均近婚系数也是重要的指标。平均近婚系数通常可通过统计婚配类型来估算,群体中第i种婚配类型的常染色体遗传近婚系数为Fi,共有Ni对,则群体平均近婚系数计算公式如下:

 例题:在一次群体调查中发现,在1000例婚配,中兄妹婚配1例,姑侄婚配1例,舅甥女婚配1例,表兄妹婚配45例,二级表兄妹婚配18例,二级半表兄妹婚配6例,三级表兄妹户内3例,其余为非近亲婚配。这个群体的平均近婚系数是多少?
解:列表计算如下:

(三)近亲婚配对基因型频率的影响

 基因型频率与近亲系数F、群体基因频率为p和q的关系如下:
                        
                         
                         

显然,近亲婚配增加了隐性纯合子的频率。一代堂表兄妹姐弟婚配的子女的近婚系数为1/16,后代AR病发病风险为q+pq/16,与随机婚配比较,增加p/(16q)倍。显然,隐性遗传病越罕见(q越小),增加的倍数就越多。因此近亲婚配对群体有害。

二、选择

选择反应了环境因素对特定表型或基因型的作用,使个体的生活力和生育力改变。遗传学上用适合度来衡量生育力的大小,用选择系数来表示选择作用下适合度降低的程度。

(一)适合度

适合度(fitness)是在一定的环境条件下,某一基因型个体能够生存并将基因传给后代的几率,通常用w表示。适合度的大小用相对生育率表示。

                      

其中,Na个患者共生有Ca个小孩,这些患者的Ns个正常的同胞共有Cs个小孩

例题:丹麦一项调查发现:108名软骨发育不全性侏儒生育了27个孩子,这些侏儒的457个正常同胞共生育了582个孩子。侏儒患者的适合度(相对生育率,w)是多少?
解:将数据带入公式  w = (27/108)/(582/457=0.2 

(二)选择系数

选择系数(selection coefficient,s)指选择作用下,适合度降低的程度,通常s表示。即, s=1-w

三、突变

突变是正常基因和致病基因之间的相互转换,本质上是遗传物质的改变。A到a的突变率用μ表示,a到A的突变率用ν表示。群体中每代某一基因座位上基因突变的频率大约为105~107)。

突变会使群体中致病基因频率上升,而选择可淘汰掉部分致病基因。当群体平衡时, 突变增加的基因等于选择淘汰掉的基因。突变率的计算公式

AD:ν=sp       (ν是a到A的突变率

AR:μ=sq2       (μ是A到a的突变率

XD:ν=sp        (ν是a到A的突变率)

XR:μ=sq/3    (μ是A到a的突变率

实际工作中,可通过群体发病率估算基因频率后结合选择系数计算突变率

(一)显性致病基因突变率的计算(直接计算和用公式ν=sp计算)

例题:在100000个出生人口中有12人患同一种AD病,其中的两个患儿的父母一方有同种病, 其他10个患儿是由于基因新突变所致。求突变率。
解:通过新发病例可知:突变率=10/(100000×2)=1/20000

 例题:94075婴儿中有10个为某AD病患者,求突变率ν。(该病s=0.80 )
解:发病率Ⅰ=10 /94075=1.063×10–4
发病率Ⅰ=p2+2pq≈2pq≈2p   →   p=(1/2)Ⅰ   
          μ=sp=s (1/2)Ⅰ=0.8×1/2×1.063×10–4=4.25×10–5

(二)AR致病基因突变率的计算(μ=sq2

例题:苯丙酮尿症(AR)的发病率为6. 0×105。求致病基因突变率。(s=0.85)
解:发病率I =6. 0×10–5=q2 
 
      突变率µ=sq2=sⅠ=0.85×6. 0×10–5=5.1×10–5

(二)XR致病基因突变率的计算 [μ=(1/3)sq]

例题:甲型血友病(XR)男性发病率为8. 0×10–5。求致病基因突变率?(该病s=0.75)

解:已知男性发病率=8. 0×10–5=q 
       突变率  μ=(1/3)sq=1/3×0.75×8.0×10
–5=2.0×10–5


四、遗传漂变

在小群体中可能出现后代的某基因频率较高,在一代代传递中基因频率明显改变,破坏了Hardy-Weinberg平衡。

遗传漂变的方向无法确定。究竟是那一种基因频率升高或下降,是一个随机事件。

五、基因流

随着群体迁移两个群体混合并相互婚配,新的等位基因进入另一群体,将导致基因频率改变,这种等位基因跨越种族或地界的渐近混合称之为基因流。

六、减数驱动

在减数分裂中,某个基因座位上特定的等位基因更多地被传递下去(即便这个等位基因本身可能是有害的),称为减数驱动。

七、遗传搭车

有利突变连锁的基因频率提高,称为遗传搭车。