职称:讲师
单位:南京医科大学
部门:生物医学工程与信息学院
主讲教师:高丽云
教师团队:共1位
| 学校: | 南京医科大学 |
| 开课院系: | 生物医学工程与信息学院 |
| 开课专业: | 生物信息学 |
| 课程英文名称: | Structural bioinformatics |
结构生物信息学是生物信息学的一个重要分支,主要分析和预测DNA、RNA、蛋白质等生物大分子的三维结构。DNA等生物大分子的序列决定结构,结构决定功能。各类组学的发展产生了海量的序列数据,结构生物信息学将提供有力的分析工具,以建立从序列到功能的关联。本课程不仅向学生介绍DNA、RNA、蛋白质结构预测的常用算法和工具,还将介绍蛋白质-核酸、蛋白质-蛋白质相互作用的预测算法和工具,并进一步研究和探讨染色质结构的形成和调控机制。本教学大纲适用于生物信息学专业教学,作为一门重要的专业课,该课程学习结束后,学生应掌握生物大分子结构预测的基本思想和软件工具,为将来从事相关的工作和应用研究打下坚实的理论基础。
| 课程章节 | | 文件类型 | | 修改时间 | | 大小 | | 备注 | |
| 1.1 结构生物信息学的研究内容 |
文档
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2022-03-19 | 1.05MB | ||
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视频
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2022-03-19 | 51.76MB | |||
| 1.2 结构基因组计划 |
文档
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2022-03-19 | 800.88KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 39.59MB | |||
| 1.3 结构生物信息学的应用 |
文档
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2022-03-19 | 1.19MB | ||
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视频
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2022-03-19 | 67.00MB | |||
| 2.1 核酸的结构 |
文档
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2022-03-19 | 2.29MB | ||
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视频
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2022-03-19 | 48.07MB | |||
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视频
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2022-03-19 | 44.26MB | |||
| 2.2 蛋白质的结构 |
文档
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2022-03-19 | 2.13MB | ||
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视频
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2022-03-19 | 57.16MB | |||
| 2.3 生物大分子结构的实验测定方法 |
文档
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2022-03-19 | 643.40KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 22.07MB | |||
| 3.1 PDB数据库 |
文档
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2022-03-19 | 1.53MB | ||
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视频
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2022-03-19 | 50.48MB | |||
| 3.2 PDB格式 |
文档
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2022-03-19 | 770.38KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 61.89MB | |||
| 3.3 mmCIF格式 |
文档
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2022-03-19 | 746.40KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 80.05MB | |||
| 3.4 结构数据可视化 |
文档
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2022-03-19 | 1.15MB | ||
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视频
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2022-03-19 | 47.03MB | |||
| 4.1 RNA二级结构元件 |
文档
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2022-03-19 | 753.39KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 47.85MB | |||
| 4.2 动态规划方法 |
文档
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2022-03-19 | 828.68KB | ||
| 4.2.1 碱基最大配对方法 |
视频
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2022-03-19 | 61.89MB | ||
| 4.2.2 最小自由能算法 |
视频
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2022-03-19 | 53.46MB | ||
| 4.3 比较序列分析法 |
文档
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2022-03-19 | 531.11KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 54.86MB | |||
| 4.4 组合优化方法 |
文档
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2022-03-19 | 1.08MB | ||
| 4.4.1 螺旋区堆积算法 |
视频
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2022-03-19 | 51.47MB | ||
| 4.4.2 最大权重匹配算法 |
视频
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2022-03-19 | 53.11MB | ||
| 4.5 RNA二级结构的表示方法 |
文档
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2022-03-19 | 651.78KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 27.79MB | |||
| 5.1 Chou-Fasman方法 |
文档
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2022-03-19 | 618.58KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 59.34MB | |||
| 5.2 GOR方法 |
文档
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2022-03-19 | 716.91KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 32.32MB | |||
| 5.3 同源分析方法 |
文档
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2022-03-19 | 539.05KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 15.14MB | |||
| 5.4 机器学习方法 |
文档
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2022-03-19 | 747.17KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 59.89MB | |||
| 5.5 蛋白质二级结构指定算法 |
文档
.pdf
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2022-03-19 | 692.57KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 35.38MB | |||
| 6.1 同源建模 |
文档
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2022-03-19 | 1.29MB | ||
| 6.1.1 同源建模方法原理 |
视频
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2022-03-19 | 35.93MB | ||
| 6.1.2 同源建模工具 |
视频
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2022-03-19 | 28.61MB | ||
| 6.2 折叠识别 |
文档
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2022-03-19 | 2.38MB | ||
| 6.2.1 折叠识别方法原理 |
视频
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2022-03-19 | 44.41MB | ||
| 6.2.2 折叠识别工具 |
视频
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2022-03-19 | 61.17MB | ||
| 6.3 从头预测 |
文档
.pdf
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2022-03-19 | 1.12MB | ||
| 6.3.1 从头预测原理 |
视频
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2022-03-19 | 22.11MB | ||
| 6.3.2 从头预测工具 |
视频
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2022-03-19 | 28.00MB | ||
| 6.4 蛋白质功能预测 |
文档
.pdf
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2022-03-19 | 2.01MB | ||
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视频
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2022-03-19 | 45.80MB | |||
| 7.1 DNA结合结构域 |
文档
.pdf
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2022-03-19 | 963.91KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 47.48MB | |||
| 7.2 RNA结合结构域 |
文档
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2022-03-19 | 1.13MB | ||
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视频
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2022-03-19 | 28.50MB | |||
| 7.3 蛋白质-核酸互作预测方法 |
文档
.pdf
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2022-03-19 | 471.14KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 35.84MB | |||
| 7.4 蛋白质-核酸对接 |
文档
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2022-03-19 | 653.75KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 21.16MB | |||
| 8.1 蛋白质结合结构域 |
文档
.pdf
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2022-03-19 | 776.21KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 38.82MB | |||
| 8.2 蛋白质-蛋白质互作预测方法 |
文档
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2022-03-19 | 1.65MB | ||
| 8.2.1 传统方法 |
视频
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2022-03-19 | 38.43MB | ||
| 8.2.2 机器学习方法 |
视频
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2022-03-19 | 38.48MB | ||
| 9.1 表观遗传修饰 |
文档
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2022-03-19 | 1.61MB | ||
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视频
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2022-03-19 | 49.44MB | |||
| 9.2 染色质互作 |
文档
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2022-03-19 | 488.10KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 36.38MB | |||
| 9.3 染色质结构的实验测定 |
文档
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2022-03-19 | 759.05KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 40.26MB | |||
| 9.4 Hi-C数据处理 |
文档
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2022-03-19 | 975.53KB | ||
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视频
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2022-03-19 | 49.43MB |