心性所向，对儒家，姚中秋早有自觉的亲近，硕士毕业论文即为《钱穆历史文化思想述评》。哈耶克的研究坚定了其对儒家之现代价值的体认。故从2002年前后，即自觉其儒者身份，其学术包括如下几个方面：

第一，解经。道成秩序，中国现代秩序构建事业之完成，当以归向道统为前提。为此，就必须推明中国之道，而五经就是呈现中国之道之文。因此，当代学人亟需接续经学。这就是儒学发展的方向。而这样的经学也可谓中国之人文与社会科学提供“元科学”。

有鉴于此，进入经学领域，并形成解经之现代方法，那就是，本乎古典注疏，充分运用人文与社会科学理论，解读五经。运用这种方法，姚中秋先生与任锋博士等高校青年教师和博士生会读《尚书》、《周易》等。《治理秩序论：经义今诂》则系统展示了这种解经方法的成果。本书择取五部经书中之十章予以解读，而形成了治理秩序之完整理论。

第二，述史。二十世纪以来的主流中国历史叙事是高度扭曲的，必须予以重述，从能为中国文明正名，为儒家正名。

姚中秋致力于研究中国治理秩序之历史变迁过程，探究中国治理之道，计划撰写五卷本《华夏治理秩序史》和三卷本《现代中国的立国之道》，截至目前均已有部分成果出版。两套书构成中国历史的完整叙事新框架。

其简本为《国史纲目》，以40万篇幅，缕述尧舜至今之中国治理秩序演变之历史。以钱穆先生《国史大纲》为本，参考陈寅恪、汤用彤、萧公权、余英时等先生之研究，重新发现中国人追求优良治理秩序之历史。

第三，创制。中国之道如何实现于现代社会？姚中秋一直在思考儒家价值之现代制度形态，由此形成一系列文章，部分文章结集，于2012年底出版，名为《儒家式现代秩序》。未来仍在这个方面继续思考。

同时，姚中秋不仅思考、撰述，更致力于践行。2012年6月，与蒋庆、陈明、许章润、康晓光等人共同发起成立弘道基金，旨在筹措资源，弘扬儒家理念，推进儒家价值进入现代社会。弘道基金的执行机构是弘道书院，姚中秋担任院长。