这反映了王廷相认为现存世界的每个事物（指自然事物），在宇宙的原始物质中已经具备了发展的潜在可能性，王廷相所说的种子，既不是阿那克萨哥拉所说的元素，也不是林耐所说的物种，在某种意义上他提出的是一种宇宙基因学说。

宇宙内万物的形态不断转化，地球上的物种也不断产生、进化，这是一个要以地质年代来计算的长期过程。在这个过程中，不仅有遗传，也有变异，而可以使人观察到的变异常常需要千万年以上。王廷相的种子说，是由于看到了生物的遗传方面，看到每一物种的形状代代传衍，看到大量物种在人类文明的记忆中很少变异，于是推断物种从来不变：“万物巨细柔刚各异其材，声色臭味各殊其性，阅千古而不变者，气种之有定也。人不肖其父则肖其母，数世之后，必有与祖同其体貌者，气种之复其本也。”