主要原因有：

1.食品产业发展很快，但门槛低、分布散、规模小的状况短期内难以完全改变，严重制约食品安全水平的提高。

2.从业人员素质参差不齐，企业主体责任落实不够，行业诚信道德体系建设滞后。

3.相对于食品产业的高速发展和食品消费结构的快速转变，安全监管能力未能及时跟上。

4.食品安全违法犯罪成本不高，惩戒威慑力度仍需加大。

食品安全问题在现阶段较多出现，有其深层次原因，其中有的与当前经济社会发展的水平密不可分。这些问题虽然复杂，但并非没有解决之道，是可以通过系统施策、多措并举而逐步加以解决的。