集中军权，设立锦衣卫

在朱元璋看来，作为一名皇帝，除了控制国家的政治系统和监察系统外，对于军权的掌控同样是不容小视的。朱元璋从一名军营中的小卒一路走来，他深知军队对于一个统治者的重要性。如今，朱元璋摇身一变，已经从一名无名小卒转变成为大明王朝的皇帝了，控制军队对他来说显得格外重要。

军队是“家天下”的柱石这个道理，对于手提三尺剑，靠武力起家，最终实现剪灭群雄、统一南北的朱元璋来说，自然是深谙其义的。他深知，要牢固掌握自己好不容易开创的这份“家业”，首先必须牢牢地掌握军队。朱元璋与刘基在权衡了历代兵制的利弊之后，创建了颇具特色的卫所制度。卫所制度的核心是属下分权，皇帝集权。

五军都督府只掌管军籍、军政事务，但武职的任免、升调和军队的训练等兵权，却不归于都督府，而归兵部。也就是说，兵部掌兵权，手中却没有军队，调兵需通过皇帝。打仗时，由皇帝亲自任命将帅，下令征调各地军队；战毕，统兵者归还将印，军士归还原卫所。都司、卫所是管理军队的系统。各地军队通过都司，总属中央的五军都督府；各省军政通过都司，总属兵部。与都督府一样，都司也无调兵权。分布在全国各地卫所的军队不受各地行政长官的管辖，军队自成一体。军人单独册立军籍，世代相袭为伍。军队耕战结合。平时军训屯田、保境安民，战时听命于朝廷。

朱元璋用这种办法控制军队，保证了全国军队一盘棋，而每个军卒都成了皇帝手中的棋子。但是，偌大一支军队没有人管理也是不行的，后来，朱元璋任命自己的外甥李文忠为大都督。朱元璋前后两次任命大都督，皆给了自己的子侄亲信，但实权还是掌握在自己手中，从中可见朱元璋的心思之细密。

这样，朱元璋在开国之初便轻而易举地使功臣宿将脱离了军队，避免了功臣宿将拥兵自重与皇家抗衡的可能，这比宋太祖赵匡胤的“杯酒释兵权”要高明得多。

朱元璋的特务网主要由检校和锦衣卫组成。早在开国前，性喜猜忌的朱元璋便使用了他的义子亲信们做检校，作为他的心腹耳目，监视部下的一举一动。检校是朱元璋特设的特务人员，他们的专职是“伺察搏击”，告发别人的隐私。

检校是职务，不是正式机构，也不是临时机构，它只能执行察听、侦伺工作，没有权力扣押人犯和处刑。胡惟庸案爆发以后，皇权与相权争权夺利的斗争更加尖锐了，于是，在洪武十五年，朱元璋设立了一个公开的特务机构，设有专门的法庭和监狱，这就是历史上知名的锦衣卫。

锦衣卫不受任何部门的管辖，由皇帝直接指挥，只对皇帝负责。锦衣卫没有指挥使一人（正三品）为最高统帅，下设同知二人，佥事三人，镇抚二人，十四所千户十四人，这些是锦衣卫的高级领导。

朱元璋深知自己跟前朝皇帝不同，他没有显赫的家底，连一直当做榜样学习的刘邦都不如，人家好歹做过泗水亭长，而自己只是个放牛娃，还做过和尚和乞丐，没有威风八面的亲戚，只有随他一起长大的同伴。如今，好不容易打下了江山，自然想好好地保护，不被别人夺取，既想自己的手下出力，又害怕他们中有人对自己不忠甚至下黑手。所以，思来想去，靠得住的也就只有锦衣卫这帮人了，毕竟他们常年侍奉在自己身旁，赢得了自己足够的信任。

皇帝既然信任锦衣卫，他们的傲慢无理、为所欲为之心便顿时膨胀起来。锦衣卫不受司法机关的管辖和制约，可以随便抓捕犯人，并审判。在逮捕犯人之前，锦衣卫指挥官会发逮捕证，锦衣卫持有它逮捕人犯不会受到任何人的阻拦，如果谁敢反抗，格杀勿论。朱元璋明白，建国之初政局不稳，他时刻提防身边人，源于以前的深刻教训，自己的女婿、亲侄子的背叛，让他变成了一个多疑的人。无奈之下设立特务机构虽然使得百官每天提心吊胆，使得他们不敢有杂念，但是长此以往也会导致人心惶惶，国家法律的权威性和约束力就会受到挑战，甚至会荡然无存。于是在洪武二十六年（1393年），朱元璋命令撤销锦衣卫，所有内外案件的审理，不论大小都要通过正常的法律手续由司法机构办理。为了显示废除锦衣卫的决心，朱元璋还将锦衣卫的刑具全部焚毁。