权责分明，设都察院行六部制

朱元璋取消中书省，罢黜丞相一职，这样大权就集中在了朱元璋一个人的手中。但是，朱元璋是皇帝，国家那么多事情需要他去处理，所以朱元璋表面上仿效古代六卿之制，提高原来在中书省之下的六部的地位，把原来属于丞相的政务分给六部，以六部治国。明朝还设立了都察院，行使监察职责。

明朝建立初期，监察机关还是元朝的御史台。洪武十三年（1380年）罢御史台，十五年（1382年）改设都察院，长官设左右都御史、左右副都御史、左右佥都御史。都御史的职责是纠劾百司，辨明冤枉，提督各道。监察御史秩正七品官，官阶虽低，但是威权甚重，皇帝用他们来钳制高官，以小制大，赋予他们足够大的权力，他们想说什么就说什么，想告发谁就告发谁。他们就是皇帝的耳目，替皇帝听下面的声音，代皇帝看下面的情况，随时向皇帝禀报。在朝廷里，他们监视一切官僚机构；外出巡按，号称自己代替皇帝巡查地方，大事奏请上级裁决，小事当机决断，可以说是最有权威的一个差官。

朱元璋废中书罢丞相后，以六部治国。吏部、礼部、兵部、户部、刑部、工部，每部设尚书一名，左右侍郎各一名。朱元璋提高了原来在中书省之下的六部的地位，吏部居六部之首，总管全国官吏的诠选、任命、考核、升降，下设文选、验封、稽勋、考功四个清吏司。礼部总掌制诰、典礼、祭祀、宗教、教育、贡举和外交，下设仪制、主客、祀祭、精膳四个清吏司，另辖铸印局等。兵部总管天下武官的任免、武器装备，下设职方、车驾、武选、武库四个清吏司，另辖会文馆等机构。户部管理天下户口、田地徭役赋税以及商业税，下设十三个清吏司，另辖印钞局等机构。刑部总掌天下刑法、监狱，下设十三个清吏司。工部掌管工程兴作、农田水利、交通等，下设虞衡、营缮、都水、屯田四个清吏司，另辖军器局等机构。六部直接对皇帝一个人负责，奉行皇帝的意旨治理国家。

除了都察院和六部之外，明朝的中枢官制还有掌管皇族属籍的宗人府，掌平反刑狱案件的大理寺，掌制诰、史册、文翰、讲读经史、修撰国史的翰林院，掌祭祀礼乐的太常寺，掌管朝会宾客礼仪的鸿胪寺等。

这样，朱元璋把权力分配给了不同的中央行政机关，一方面使得权责分明，更好地管理国家政事；另一方面可以分权，使各个部门既互相合作，又互相制约，最后将大权牢牢地掌握在自己手中。