研究方法

数学与统计学方法

在对群体作抽样调查的基础上，对群体中基因的频率和由于不同交配类型所造成的各种基因型在数量上的分布进行分析。这一方法又可分为静态的和动态的两种。静态的方法研究的是群体在同样生态条件下不同基因型所发生的遗传变化，或是群体中相同的基因型个体在不同生态条件下所发生的遗传变化。动态的方法研究的是群体的遗传结构和生态环境两方面都发生改变的情况下生物对环境的适应和反应。

野外群体研究方法

最常见的是捕捉某些野生动物如昆虫、鸟类、鱼类和小型兽类进行观察，对它们施加某种标记后释放回去，经过一段时期再行捕捉。根据再次捕捉中有标记动物和无标记动物的比例，可以大致估计这一地区某种动物的数量和活动范围等。如果施加的标记带有无线电接受器，还可以跟踪它们的活动范围。

实验室群体研究方法

在实验室的条件下，对某些已知遗传结构的群体进行选择、杂交、随机漂变、基因型与环境互作等试验，以观察群体适应度和基因频率的变化。

计算机模拟

无论是对野外群体还是实验室群体，人类在一生中所能观察到的世代数是很有限的，不可能对千百年生态条件作用下生物的遗传变化进行实际观察。应用计算机可以模拟不同的选择压、突变率、迁移率、繁殖率、近交和随机漂变等因素作用下遗传变异的长期效应，从而对种群进化（或退化）和动植物遗传资源的保护、利用作出预测。

分子遗传学方法

从分子水平研究生态遗传学的方法。例如对果蝇作热应激的处理，然后从DNA的变化上来研究对热处理的反应，从而探讨适应的遗传基础。