第二节　清代

清朝建立后，先是甘、凉、肃三州及西宁各设马厂分五群，群储牝马二百匹、牡四十。寻改甘州厂属巴里坤。顺治初，设洮、岷、河州、西宁、庄浪、甘州茶马司及开成、安定、广宁、黑水、清平、万安、武安七监，岁遣御史一人专理之。康熙七年（公元1668年），裁茶马御史，马政归甘肃巡抚。乾隆中期，新疆伊犁、哈萨克马群大为发展，陕甘营马不足亦调伊犁、哈萨克马补充。清代在牧区少数民族仍行贡马制，各地贡马匹数不定。甘肃唐古特（藏族）七族西喇古儿例贡马匹各营最多者八十二匹，少者递减至二、三匹。道光以来马政逐渐衰弛。

清初规定现任官可以养马，其余悉禁。不久允许武进士、武举人、兵丁、捕役养马。康熙元年（公元1662年）禁民人养马，禁止私贩马匹。康熙十年（公元1671年）下令民人允许养马。雍正十三年（公元1735年）规定“马驼出厂时毛齿皆有册回日覈验，如疲瘠十不及三免议，否则兵鞭责，官罚俸有差。”“乾隆初禁牧丁等盗马私售及与人乘，峻其科罚。十六年严牧马减尅料草之罪。二十八年官马出青，每百匹准倒十匹逾额勒其买补。”（《清史稿·食货志》）

嘉峪关及其邻近之堡在清前期因经略新疆有军事防御功能，故有一定数量骑兵马匹，其牧放、操驯、使用，大体遵照肃镇规定，装备、配拨亦由肃镇安排，乾隆中期后新疆平定，军事防御地位日渐消失，加之清朝后期吏治腐败，军队也日益衰朽，嘉峪关兵员大减，关城、长城颓废，防御功能全失，肃州乃至河西的茶马市易、马政之事亦随之弛废。