二、清廷册封“班禅额尔德尼”

由于桑结嘉措对五世达赖喇嘛圆寂隐匿不报、暗中私通怂恿噶尔丹作乱以及桑结嘉措与拉藏汗的争权斗争危及清朝政府对西藏、青海甚至新疆的统治。康熙皇帝早在1695年（康熙三十四年）就决定召五世班禅罗桑益西（1663—1737年）入京朝觐，遣内齐陀音呼图克图和监察御史钟申保等奉旨往召，意在提高班禅的宗教地位和社会威望，让他管理黄教事务以遏制第巴专权。因五世班禅以未出痘为由，未能应召入京。1707年，废黜了仓央嘉措之后，拉藏汗便立益西嘉措为六世达赖喇嘛，并亲自到扎什伦布寺请求班禅为益西嘉措剃度、取法名、授沙弥戒。但是，拉藏汗拥立的六世达赖喇嘛益西嘉措既得不到三大寺为代表的格鲁派上层的认可，也得不到青海蒙古王公的拥护。青海诸台吉纷纷上书朝廷，奏呈益西嘉措是假达赖。清朝中央政府深知达赖喇嘛废立的重要，康熙帝遂派内阁学士拉都浑率青海众台吉的代表前往西藏查验。拉都浑等人在西藏同拉藏汗、五世班禅进行了会晤，详细了解了有关拉藏汗拥立益西嘉措之事，并听取了多方面的意见。回京后如实奏报。康熙帝听了众大臣的讨论，出自对青海、西藏社会安定的考虑，认可了益西嘉措为六世达赖喇嘛。康熙四十八年（1709年）三月，鉴于西藏、青海形势日趋不稳，“青海众台吉与拉藏不睦，西藏事务不便令拉藏独理”。于是派侍郎赫寿领“管理西藏事务”衔进藏，协同拉藏汗办理西藏事务。章嘉呼图克图和哲布尊丹巴呼图克图也派代表陪同赫寿进藏。赫寿在藏两年间，除协管西藏事务外，组织测绘人员奉旨绘制了西藏地方地图。赫寿进藏是清朝中央政府直接派员驻藏管理西藏事务的开端。赫寿本人也是绘制西藏地图的创始人。

赫寿入藏第二年，会同拉藏汗、五世班禅和部分寺院上层上奏朝廷，为益西嘉措为六世达赖喇嘛请封。康熙帝降旨正式册封益西嘉措为六世达赖喇嘛，并赐封印。但益西嘉措仍未能得到西藏、青海僧俗界的公认。几乎与此同时，由于仓央嘉措在进京途中病逝于青海境内后，三大寺上层便在暗中寻访其转世灵童。最后认定1708年出生于四川理塘的一个幼童为仓央嘉措的转世灵童，并立即得到了青海蒙古各台吉的响应。在这种情势下，康熙皇帝于1713年2月24日（康熙五十二年正月三十日）颁诏册封五世班禅罗桑益西为“班禅额尔德尼”；赐满、汉、藏3种文字的金册一份、金印一颗。其诏书为：

奉天承运皇帝敕曰：

朕抚临寰宇，慈爱众生。凡恪守戒律循规，为人安静、勤奋修道者，将颁赐封号，以示朕嘉奖之至意。尔班禅历辈遵奉教法，为人安静，熟谙经典，勤修贡职，初终不倦，致使佛教得以弘扬，甚属可嘉。尔出于心悦至诚，遣使前来请安进贡。故朕特赐尔赦谕，颁金册、金印，封赐班禅额尔德尼名号。札（扎）什伦布寺所属名寺、庄园为尔静养之地，他人不可借口滋事。尔应勤奋净修佛法，悉心教诲僧侣，修成正果。特谕。

从此班禅的宗教领袖地位得到清朝中央政府的进一步确认，历代班禅皆受中央政府册封遂成定制。