在所有通过选举实现政党轮替的非洲国家，选举委员会都是独立的，而且是高度公正的。负责举行选举的机构要保持自主，而不是政府各部的延伸（如一些非洲法语国家的情况），官员的任期有保障，部门预算受到法律保障，并由他们自己控制（接受审计），这样才能保持选举机构的独立性。例如，加纳选举民主的成功就要部分归功于该国选举委员会的独立性和公正性。根据法律，选举委员会的资金来自政府的合并账户，并可通过法院命令得到保证。委员们的任期受到保护，他们的地位和工资与法官的地位和工资挂钩。

司法机构在解决选举争端方面的作用对于选举的成功也至关重要。具有独立和公正形象的法院迅速作出裁决，可以减少选举失败者诉诸街头示威和暴力的可能性。在很多非洲国家，法院并不独立，也没有能力作出迅速和可信的反应。南非和加纳是例外。尼日利亚的案例说明了加强司法在选举中作用的可行性。自2010年开始选举改革以来，选举争端现已可在尼日利亚法院得到快速处理，并能比过去更快得到解决。