在一些地区，宗教专家参与到了反对欧洲帝国主义的武装斗争中。让我们举个例子细说。殖民统治期间，德国在现今坦桑尼亚的土地上征税并推动了橡胶采集和棉花种植业的发展。事情的导火索是1905年的一场严重干旱，在这之后很多农村居民起来反抗殖民地中间人，并最终与德国军队作战。许多团体参与了其中，但这次运动后来被称为马及马及起义（Maji Maji）的原因，是宗教专家用水［马及（maji）］和其他物质制成、可以帮助信徒抵抗子弹的饮剂。灵媒金吉基蒂勒·恩格瓦勒（Kinjikitile Ngwale）是最早调制马及保护剂的人，他和其他与运动有关的仪式专家在德国当局镇压反抗时被抓捕并杀害。另一个例子发生在1915—1917年的布基纳法索，当时，当地居民利用第一次世界大战的机会，趁法国军事相对软弱的时候奋起抵抗。不同的团体利用宗教专家控制的当地神龛网络努力组织斗争。在这个案例中，穆斯林与非穆斯林一起面对敌人，并肩作战，因此也都成为法国人的攻击目标，并且在这项失败的运动中有人丧生。

殖民时代的变迁影响了当地的宗教习俗。欧洲殖民官员鼓励开展在他们看来能巩固殖民管理中非洲中间人权力的仪式，但在某些情况下，这些仪式是“捏造的传统”，与持续的文化习俗并无联系。欧洲人还积极劝阻或取缔某些被认为有争议的做法或挑战他们统治的仪式，迫使它们离开公众的视线。随着宗教专家日渐式微，许多人可能调整甚至放弃了他们的宗教习俗。例如，以前广泛开展治疗的专家变得只在个别情况下看一些不孕不育的病例；关于健康和治疗的章节将会为我们揭示这些实践的活力。一些根源于非洲的宗教在殖民时代得以延续，但有时也需要秘密进行，当地宗教习俗的要素仍然是当代艺术和音乐表达、政治仪式及其他活动的来源之一。例如，当代马里的多贡（Dogon）社区定期组织面具舞，并邀请外人见证他们的一些仪式和典礼。

一些根源于非洲的宗教在殖民时期得到了扩张。例如，在今天的加纳东北部地区，英国人盯上了位于通山（Tong hills）的一个祖先和大地神龛建筑群，认为其是颠覆当地统治的源头。英国官员派遣一支军队摧毁了这些洞穴，然后重新安置居住在建筑群附近的非洲居民，试图消除神龛的影响。20世纪20年代英国放宽限制后，之前的祖先崇拜教派之一——“通纳布”（Tongnaab），在加纳南部一个新的神龛网络中兴盛起来，其他族群在猎捕巫师时也需要以“纳纳·通加”（Nana Tonga）的名义利用这一网络。当一些非洲人获得了财富，并不再承认社会义务时，巫术指控就会有所增加，当地认为北部地区没有不合群者是由于其神灵的效力，纳纳·通加猎巫的声誉因而得到加强。直到今天，通纳布和纳纳·通加的嬗变一直在进行时，其神龛网络仍然活跃，来自加纳以外的游客也来到通山参观。

殖民时期，根源于非洲的宗教也借用了基督教的象征。例如，自20世纪20年代开始在加蓬进行、被称为“布维地”（Bwiti）的一场运动建立了一个教会网络，强调以仪式和其他共同宗教体验为支撑的平等主义。祖先在布维地中占据重要位置，入会仪式也很重要，人们会服用一种本地的致幻物质，载歌载舞。虽然布维地的核心宗教体验是与耶稣基督的相遇，但这个形象不是基督教教义中的“上帝之子”，而是以当地的一名治疗师作为代表。布维地的一些成员在基督教传教士举办的学校接受过教育，但他们和其他信徒都不会声称自己是基督徒。布维地是一种根源于非洲的宗教，它利用基督教的象征，在殖民时代的变革中被赋予了关联和权威。它借鉴了具有深刻历史共鸣的思想和实践，吸收了基督教的成分并将之融入了自身复杂的仪式和象征意义中。