一是没有专门的蜜瓜产业技术机构，新品种、新技术的试验示范、病虫害的防治等超前研究缺乏技术支撑，技术不能得到很好的普及和应用；二是从事蜜瓜产业的技术人员少，力量薄弱，蜜瓜种植区域分散，涉及6个乡镇37个村222个村民小组，面广量大，田间管理、病虫害防治等技术指导服务不能及时到位；三是虽然依托科技示范县实施、全国西甜瓜产业体系建设和甘肃农科院、甘肃农业大学、酒泉市农科所等建立了合作关系，但是只能是阶段性技术指导服务，无法实现跟踪技术指导服务，也不能作为今后瓜州县蜜瓜产业的健康发展技术支撑；四是农户对无公害标准化生产和品牌意识不强，随心所欲，不能严格按技术规程操作,商品意识差,造成蜜瓜含糖量下降、品质降低、产品商品率低，将影响今后瓜州县蜜瓜产业的健康发展。