天然植被的种类分布、形态特征、生存演变决定于其赖以生存的生态环境条件。瓜州县属于温带、暖温带干旱荒漠气候，主要土壤类型为灰棕漠土、棕漠土、草甸土、风沙土以及盐土。气候、土壤、水热条件的差异，使植被分为以下几个类型：

1.戈壁荒漠草场类型：分布在南北山区和戈壁地带，结构成分简单，植丛稀疏，多为旱生、超旱生种。有拐枣、合头草、棱棱、泡泡刺、针茅、蒿草、骆驼刺、红沙、珍珠、苏枸杞、杈+枝鸦葱、花棒、假木贼、蛛丝盐生草、霸王、沙葱、红柳、麻黄等，覆盖度山区5%～15%，戈壁＜5%。

2.沼泽—盐化沼泽类型：分布在布隆吉、桥子、东巴兔、踏实、截山子南侧的沼泽地和河谷。主要生长着芦苇、蒲草、沼针兰、海韭、水葱杆、盐角草、三棱草、北京大戟、酸模、泽泻等。

3.草甸—盐生草甸类型：在全县分布最广泛。主要有芦苇、芨芨、冰草、甘草，伴生有骆驼刺、罗布麻、苏枸杞、马蔺、碱蓬、苦豆子，少数地区有红柳，覆盖度30%～50%，局部地区70%～90%。为瓜州县最优良的牧场。

4.荒漠化盐生草甸类型：属于草甸向荒漠演变的过渡类型，多分布在地下水位较低，盐渍化程度较高的地方，植被稀少。主要有鸡爪芦苇、冰草、芨芨，盐生、耐盐生半灌木苏枸杞、骆驼刺、罗布麻、胖姑娘、少量的甘草、苦豆子等。

5.盐生荒漠类型：主要分布在疏勒河下游以及黄水沟下游两侧。土壤含盐重，只有盐生灌木和半灌木生长，有盐棱棱、胖姑娘、苏枸杞、骆驼刺，少量的红柳、胡杨、芦苇、芨芨，覆盖度小于15%。

6.沙生植被类型：主要有红柳、胡杨、花棒、沙蒿、沙蓬、泡泡刺、黄花矶松、盐棱棱、甘草等。分布在西沙窝、黑沙窝、东沙窝、泉子以东，三工至四工、老师兔以南的沙地上，覆盖度一般为2%～5%，地下水位较高的低洼处覆盖度10%～50%。

7.绿洲农田植被：有小麦、玉米、胡麻、蚕豆和各种瓜菜。农田杂草种类繁多，主要有灰绿藜、田旋花、萹蓄、苣卖菜、蒿子、蒲公英、苦豆子、燕麦、冰草、芦苇、辣辣姜、苍耳、甘草、谷莠子、稗子、苏枸杞、芨芨、野苜蓿等。人工栽培的林果植被有沙枣、榆、毛柳、梨、杏、桃、苹果、葡萄和少量枣树。