导致传染病的主要病因为时行疫毒，或称疫戾之邪。“疫”作为疾病名称，具有传染性和流行性的特征。而在疾病性质上又有温病的性质，亦有寒、热、湿、燥的不同，包括范围较为广泛。小儿疫病有风温、风热、湿热、寒湿之别，以风温疫毒、风热疫毒、湿热疫毒为多见。

1.风热疫毒　风热和疫毒合邪称为风热疫毒。风热疫气从口鼻而入，主要病变部位在手太阴肺经，肺主气，外合皮毛，肺受邪袭，初起症见肺卫表证，日久多耗伤肺胃阴津。因风邪“善行数变”，又易出现逆传心包等危重证候。正如叶天士《温热论》所说：“温邪上受，首先犯肺，逆传心包。”如麻疹、风疹、奶麻、痄腮之邪等。

2.温热疫毒　表现为温热性质的温疫称为温热疫毒。发病更急，症状重，初起即可引起肺胃病变，迅速充斥表里、内外，弥漫上、中、下三焦，温热疫邪炽盛可内扰心神，迫血动血，瘀热搏结，或蓄血于下，还可出现多脏腑同病，后期温热疫邪伤及气阴，可出现气阴两伤。如猩红热之邪等。

3.湿热疫毒　表现为湿热性质的温疫称为湿热疫毒。湿热病邪多以足太阴脾经为主要病变部位，有湿重于热和热重于湿的差异。素体中阳偏盛者，病位多在胃，表现为热重于湿；素体中阳不足者，病位多在脾，表现为湿重于热。如水痘、手足口病之邪等。