肱骨近端骨折的并发症包括畸形愈合、肱骨头缺血坏死、骨不连、关节僵硬、创伤后关节炎等。此外，手术患者还可发生感染、骨折移位、内固定松动、失效等手术相关并发症。

畸形愈合在保守治疗中较常见，也可因手术治疗后复位不佳或继发移位导致。多数畸形愈合患者一般能够耐受，不需进一步治疗。但畸形也可引起明显的疼痛和功能障碍，以大结节畸形愈合导致症状多见。此时，必须仔细鉴别症状的来源，因为肩袖损伤、创伤后关节僵硬、肩锁关节功能障碍、肱二头肌肌腱病以及区域疼痛综合征等均可以引起肩部的症状。有症状的畸形愈合经保守治疗后仍无改善，可行手术矫形，严重的畸形可行肩关节置换治疗。

肱骨头缺血坏死是肱骨近端骨折较严重的并发症。一些骨折损伤内侧软组织铰链，容易发生缺血坏死，如严重的骨折—脱位型损伤造成肱骨头游离，明显的外翻型损伤内侧骨折移位明显等；手术中广泛的剥离和粗暴的操作也可损伤肱骨头残余的血运[28]。临床表现主要是疼痛、关节僵硬、功能障碍。影像学可表现为肱骨头硬化、塌陷甚至吸收，内固定的患者可发生螺钉穿出关节面。部分肱骨头缺血坏死的患者可能没有明显症状，不需进一步治疗，可定期随访观察。但多数患者会逐渐出现伴有疼痛和功能障碍的肱骨头塌陷，需要进行关节置换。肱骨大结节骨折也可发生缺血坏死，主要见于老年患者，表现为大结节的硬化、吸收。由于肩袖止点的缺失，治疗只能采用关节置换。

骨不连在肱骨近端骨折相对少见。手术是治疗骨不连唯一有效的方法，根据情况可进行植骨内固定，或者行肩关节置换。

创伤后肩关节僵硬的主要原因是制动后关节囊挛缩，需要鉴别肩袖撕裂或撞击所致的关节功能障碍，以及畸形愈合、肩峰撞击、区域疼痛综合征等原因。主要表现为肩关节被动活动受限，尤其以外展及外旋受限最为明显。治疗上以康复治疗为主，也可行麻醉下的手法松解。