继发于胆道梗阻性疾病的急性胆管感染，均有肝内和（或）肝外胆管以及胆管周围组织的急性、亚急性和（或）慢性弥散性化脓性炎症改变。主要表现为胆管黏膜充血，水肿，出血，加重胆管的梗阻，胆汁逐渐变成脓性，胆管内的压力不断增高，梗阻近侧的胆管逐渐扩大。在含有脓性胆汁的胆管高压的作用下，肝脏可肿大，肝内小胆管及其周围的肝实质细胞亦可发生炎性改变、肝细胞大片坏死，形成肝内多发性小脓肿。胆管也可因感染化脓造成黏膜糜烂、坏死、溃疡和胆道出血。胆管内高压造成肝内毛细胆管破溃，脓性胆汁甚至胆栓即由此经肝内血窦进入血液循环，造成菌血症和败血症。少数还可发生肺部脓性栓塞。在后期，可出现神经精神症状、发生感染性休克、肝肾功能衰竭或弥散性血管内凝血等一系列病理生理变化，此即为急性梗阻性化脓性胆管炎，又称重症型胆管炎，或称急性中毒性胆管炎。即使手术解除了胆管高压，但这些病理改变在肝实质和胆管仍会留下损害，这也是本症的严重性所在。