伴随着祖国数千年的悠久历史，古代医学家在口腔解剖生理学的发展史上也曾经作出重要的贡献，早在几千年前已有口腔解剖生理学方面的论述。例如公元前3世纪的《黄帝内经》中关于口腔解剖生理的知识已有广泛记载，其中对牙的萌发时间，以及口腔有关器官的结构特点均有所描述。唐代孙思邈所著《千金翼方》中对颞下颌关节脱位整复手法也有较详细的记载，可见祖国医学家对口腔解剖生理知识的了解，已经具有一定的深度。

但在旧中国，由于漫长的封建及半封建半殖民地社会制度的束缚，口腔解剖生理学与其他学科一样未能得到应有的发展。新中国成立前我国仅有5所牙医学校，从事口腔解剖生理学的教学和科研人员屈指可数。新中国成立后，口腔医学教育和口腔保健事业得到了迅速发展。目前全国已有数十所高等医学院校设立了口腔系或发展为口腔医学院，各中专卫校也相继设立了口腔专业，培养了大批高、中级口腔专业人才，为我国口腔保健事业作出了巨大贡献。根据口腔医学发展的需要，1973年口腔解剖生理学作为一门独立学科单独开设，使这门学科得到了迅速发展，更加体现出科学性、先进性和实用性相结合特点。国内知名大学口腔医学院的许多著名专家对牙体解剖、、下颌运动、颞下颌关节、口腔功能及口腔美学方面都进行了较深入的研究，取得了丰硕成果。这些成果既充实了国人口腔解剖生理学资料，又为临床应用提供了基础理论依据。同时，随着生活水平的提高和健康观念、美容观念的日益更新，人们对口腔美容提出了更高的要求。同时材料学、电子仪器设备和美容技术的飞速发展，各级医疗卫生机构中口腔修复科和义齿制作公司的现代技术含量不断提高，对从事口腔医学技术工作的技术人员的素质也提出了更高的要求，从而也促使口腔解剖生理学向着更高的层次发展。