甾体类雌激素的基本结构为A环的芳香化，C-3位的羟基，C-17β-羟基的甾体母核，且C-3位的羟基与C-17β-羟基的距离应该在1.02～1.45nm之间，化合物应该是一个平面的疏水分子。

甾体母核上的取代基可以显著的影响化合物的雌激素活性。对甾体母核的C-1位进行取代，雌激素活性大大降低。C-2位和C-4位上有小体积的取代基，雌激素活性还可保留。C-6位、C-7位和C-11位如果被羟基取代，则雌激素活性降低。由于C-17β羟基的存在，产生的α构型差向异构体雌激素活性较低。