阴阳理论可以为人体脏腑的组织结构归类，概括它们之间的相互关系。中医学认为，尽管人体上下、内外及脏腑组织结构十分复杂，但均可以用阴阳来加以概括和阐述。具体言之，就是上为阳，下为阴；外为阳，内为阴；背为阳，腹为阴；六腑属阳，五脏属阴。

此外，阴阳之中可再分为阴阳：五脏为阴，但心肺属阳，心为阳中之阳，肺为阳中之阴；肝脾肾属阴，但肝又为阴中之阳，脾为阴中之至阴，肾为阴中之阴。

由此可见，阴阳之分具有相对性。在气血运行的生理活动中，气为阳，因气法乎上；血为阴，因为血似水而法乎下。两者之间，“气为血帅”“血为气母”。