1.吻合器不能插入管腔 主要原因是吻合器选型过大。应根据肠管直径选择吻合器。

2.吻合器退出困难 其主要原因是吻合器选型过大和吻合口切割不全。如为切割不全应重新吻合。

3.吻合口周边组织裂开 组织过厚或消化道管壁水肿时使用吻合器可能出现组织裂开，如出现这种情况，可进行修补，但以徒手缝合为妥。

4.吻合口出血 出血原因包括吻合组织过薄或缝合了系膜血管。预防方法为选择钉脚长度合适的钉仓并避免压榨系膜血管。

5.吻合口梗阻 主要原因为吻合器选型过小或两个吻合端扭曲。缝合不全或吻合口切割不完全主要原因有，消化管周围系膜或网膜组织没有清除、吻合器没有旋紧至合适位置、钉仓内组织嵌入组织过多、吻合口张力扩大、荷包缝合线滑脱等。在退出吻合器后，应常规立即检查切除圈是否完整，如发现切除圈不完整，必须在相应位置全层加固缝合。