MapGIS 的主要功能包括数据输入、数据处理、数据库管理、空间分析、数据的输出。

（1）数据输入

在建立数据库时，人们需要将各种类型的空间数据转换为数字数据，数据输入是GIS 的关键之一。MapGIS 提供的数据输入有数字化仪输入、扫描矢量化输入、GPS 输入和其他数据源的直接转换。

（2）数据处理

输入计算机后的数据及分析、统计等生成的数据在入库、输出的过程中常常要进行数据校正、编辑、图形整饰、误差消除、坐标变换等工作。MapGIS 通过图形编辑子系统及投影变换、误差校正等系统来完成。

（3）数据库管理

MapGIS 数据库管理分为网络数据库管理、地图库管理、属性库管理和影像库管理4 个子系统。

（4）空间分析

地理信息系统与机器辅助制图的重要区别就是它具备对中间数据和非空间数据进行分析和查询的功能，其包括矢量空间分析、数字高程模型（DTM）、网络分析、图像分析、电子沙盘5 个子系统。

（5）数据的输出

如何将GIS 的各种成果变成产品供各种用途的需要，或与其他系统进行交换，是GIS 中不可缺少的一部分。GIS 的输出产品是指经系统处理分析，可以直接提供给用户使用的各种地图、图表、图像、数据报表或文字报告。MapGIS 的数据输出可通过输出子系统、电子表定义输出系统来实现文本、图形、图像、报表等的输出。