病机，即疾病发生、发展、变化与转归的机理。病机学说，是研究疾病发生、发展、变化与转归的机理并揭示其规律的基础理论，主要包括疾病发生的机理、病变的机理和疾病传变的机理。

病机是对疾病本质的概括，是临床治疗的前提和依据，素为历代医家所重视。《内经》是病机理论的起源，明确提出了邪正盛衰病机和阴阳失调病机。如《素问·阴阳应象大论》提出：“阴胜则阳病，阳胜则阴病，阳胜则热，阴胜则寒”。《素问·通评虚实论》指出：“邪气盛则实，精气夺则虚”等。此外，《内经》还论述了脏腑病机、六气病机、气血病机等，为病机学说的发展奠定了基础。

东汉·张仲景著《伤寒杂病论》，其中《伤寒论》部分在《内经》外感热病病机理论的基础上，精辟地阐述了外感病六经病机的变化及其传变规律；《金匮要略》则是在《内经》脏腑和六气病机理论的基础上，对脏腑、气血、痰饮等病机进行了系统、深入的论述，并探讨了内科杂病和妇科病证的病机。隋·巢元方的《诸病源候论》是最早而且较完备的病因病机和证候学专著，其内容涉及内、外、妇、儿等各科疾病。宋·钱乙著《小儿药证直诀》，归纳了小儿“易虚易实”“易寒易热”的病机特点，首次对儿科病机进行了全面阐述。刘完素认为“六气皆从火化”，李杲确立“阴火”的病机概念，朱震亨倡“相火论”，提出“阳常有余，阴常不足”，对“六郁”病机进行了阐发。明清时期，温病学派创立了卫气营血与三焦理论，用来阐明外感热病的病机规律，并作为辨证论治的依据，是对中医病机学的重大发展。清·王清任著《医林改错》，丰富了瘀血病机理论。唐宗海著《血证论》，并有“脏腑病机论”专篇，对血证与脏腑病机作出了突出的贡献。

近年来，中医病机学得到较大发展。一是病机理论的丰富，如病机层次说、痰瘀同源说、体质病机说等新观点的涌现，同时病机学也日趋系统化；二是利用包括现代医学在内的现代自然科学方法和手段来研究中医病机理论，如对阴虚、阳虚本质的研究，瘀血病机的研究等，都取得了可喜的成果。

疾病过程极其复杂，牵涉局部和全身的各个层次，对病机的研究也可以从不同的层面和角度进行，从而形成多层次的病机理论。第一层次为基本病机，指病邪作用于人体，全身正气奋起抗邪，而形成基本病理变化。主要包括邪正盛衰、阴阳失调、精气血津液失常。第二层次是系统病机，是从脏腑、经络等某一系统来研究疾病的发展、变化的基本规律，如脏腑病机、经络病机等。第三层次是类病病机，指研究某一类疾病的发展、变化的基本规律，如六经病机、卫气营血病机和三焦病机等。第四层次是疾病病机，是研究某一种病证的发展、变化和转归的基本规律，如感冒的病机、中风的病机等。第五层次是证候病机，指研究某一具体证候的发展、变化和转归的规律，如脾胃湿热证的病机、痰饮蕴肺证的病机、肝气郁结证的病机等。第六层次是症状病机，是研究某一种症状的发展、变化的病机，如疼痛的病机、发热的病机等。本节主要研究人体整体病机，包括邪正盛衰、阴阳失调、精气血津液失调和内生五邪。