拓展阅读七  系统生物学的两个学派

       美国科学家 Hood L是现代系统生物学的创始人之一，也是HGP计划最早的倡导者之一。以Hood 为代表的一批学者关注的是“完整的生物复杂系统”，他们希望阐明生物系统完整的基因、蛋白质、信号通路和代谢途径，整合这些数据，并建立数学模型以描述系统的结构和对外部作用的反应。这种系统生物学研究思路称为“整体分析学派”（global-analysis school）。整体分析学派研究的系统可以是一个完整的个体，也可以是细胞内完整的代谢网络或信号转导网络。

       在系统生物学研究领域，也有许多科学家侧重于研究生物复杂系统的某一个局部。哈佛大学的Kirschner M认为当前系统生物学的目标“是要重构和描述同样是复杂系统的某个局部”，如以色列科学家Alon U侧重于转录调控网络基本单元的研究。这种研究思路称为“局域分析学派”（partial-analysis school）。对局域分析学派的研究者来说，选择复杂系统中恰当的“局部”作为其研究对象是研究工作的核心。这一学派的学者对复杂系统有一个基本假设：不论网络有多大，有多复杂，都是用简单的基序（motif）和模块（module）作为“砖块”搭建而成的。

       两个学派均有自己的优势，整体分析学派强调系统的整体性，但缺乏对系统的动力学过程进行详细的定量研究；局域分析学派能深入地研究系统的动力学特性，并可以对系统的结构和功能进行深入的分析。显然，整体分析学派与局域分析学派是一种互补关系，在系统生物学的发展中均有重要的作用。

【推荐阅读】

焦炳华. 组学与系统生物学. In: 冯作化, 药立波(主编). 生物化学与分子生物学. 北京: 人民卫生出版社, p612, 2015

（杨生生 焦炳华）