拓展阅读二  遗传标志（genetic marker）

        HGP实施过程中先后采用了三代遗传标志，分别为限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphism，RFLP）、可变数目串联重复序列（variable number of tandem repeat，VNTR）和单核苷酸多态性（single nucleitide polymorphism，SNP）。

        第一代遗传标志——RFLP：就是利用特定的限制性内切酶识别并切割基因组DNA，得到大小不等的DNA片段，所产生的DNA数目和各个片段的长度实际上反映了DNA分子上不同酶切位点的分布情况。由于不同个体等位基因之间碱基的替换、重排、缺失等变化导致限制性内切酶点发生改变从而造成基因型间RFLP长度的差异。

        第二代遗传标志——VNTR：又称微卫星DNA（mini-satellite DNA），是一种重复DNA短序列（每个重复单位仅由2~6 bp组成，故又称为短串联重复序列（short tandem repeat，STR）。不同数目的重复单位呈串联重复排列而呈现出长度多态性，不同个体基因组VNTR重复单位的数目是可变的，因此，形成了极其复杂的等位基因片段长度多态性。VNTR基本原理与RFLP大致相同，通过限制性内切酶的酶切和DNA探针杂交，可一次性检测到众多微卫星位点，得到个体特异性的DNA指纹图谱。

        第三代遗传标志——SNP：是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP在人类基因组中广泛存在，平均每500~1000 bp中就有1个，估计其总数可达300万个甚至更多。在人群中SNP的发生频率至少大于1%，因此不同于点突变。SNP是人类可遗传变异中最常见的一种，也是基因组中最为稳定的变异。SNP最大限度地代表了不同个体之间的遗传差异，因而成为研究多基因疾病、药物遗传学及人类进化的重要遗传标记。SNP与其他DNA标记的主要不同是不再以“长度”的差异作为检测手段，而直接以序列的变异作为标记。

【推荐阅读】

1. 焦炳华. 组学与系统生物学. In: 冯作化, 药立波(主编). 生物化学与系统生物学. 北京: 人民卫生出版社, p600-601, 2015

（杨生生 焦炳华）