（二）蛋白质的分子结构

1．蛋白质的一级结构　蛋白质分子中氨基酸的排列顺序。

主要化学键：肽键，二硫键。

作用：是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础；但一级结构并不是决定空间构象的惟一因素。

2．蛋白质的二级结构　蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构，也就是该段肽链主链骨架原子的相对空间位置　（注意：不涉及氨基酸残基侧链的构象）。

主要形式

α－螺旋：每3．6个氨基酸残基螺旋上升一圈，螺距为0．54nm；α－螺旋的每个肽键的N－H和第四个肽键的C＝O形成氢键，方向与螺旋轴平行；肽链中的全部肽键都可形成氢键。

β－折叠：两个以上的肽段锯齿状平行排列，方向可相同，可相反；肽键间形成氢键。

β－转角：肽链进行180°回折；由4个氨基酸残基组成，第2个残基常为Pro，其他还有Gly、Asp、Asn、Trp；第1个残基的羰基氧与第4个残基的氨基氢形成氢键。

无规则卷曲。

模体（motif）：2个或3个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个具有特殊功能的空间结构。

维持稳定的化学键：肽键间的氢键。

影响其形成的R基团：①影响α－螺旋形成。多个酸性或碱性氨基酸残基相邻；R基团过大；出现脯氨酸。②影响β－折叠形成。R基团很大。

3．蛋白质的三级结构　指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，也就是整条肽链所有原子在空间的排布位置。

维持稳定的化学键：次级键——疏水作用、离子键（盐键）、氢键、Van der Waals力等。

结构域（domain）：超二级结构可形成紧密、稳定且在蛋白质分子构象上明显可分的区域（50～400氨基酸残基）。分别担负着蛋白质分子不同的功能，是整个蛋白质分子中的一些生物功能实体。

分子伴侣（chaperon）：可逆地与未折叠肽段的疏水部分结合随后松开，防止错误的聚集发生；或纠正错误的聚集，诱导其正确折叠；协助形成正确的二硫键。

4．蛋白质的四级结构　蛋白质分子中各个亚基的空间排布和相互作用。亚基可相同，也可不同。

亚基：含有2条或2条以上多肽链的蛋白质中，每条肽链的完整的三级结构。

亚基间的结合力：氢键、离子键、疏水作用。