氯和钠一样也是人体细胞和体液的主要成分之一。在人体中，氯的百分组成为0.12%，占人体中含量最多元素的第十位，紧跟钠之后（钠的百分组成为0.14%，占第九位），这显然与人体中大部分钠的吸收都要伴随有氯离子的吸收有关。

细胞外的阴离子总量中，氯离子占70%左右。所以，这样看来，食盐在维持渗透压方面起着重要作用，影响着人体内水的流向。在血浆中，氯的浓度为98～106毫摩尔/升。在人体的胃液中，更有着大量的氯离子，相当于千分之几浓度的盐酸；在血液中，氯的含量为0.5克/100毫升，从含量上来讲要比钠离子略低一些。氯离子和碳酸氢根离子在血浆和血红细胞之间维持着阴离子的平衡，当碳酸氢根从血红细胞中渗透出来致使血红细胞中阴离子数目减少时，氯离子就进入血红细胞，以维持电荷的平衡，反之，也是同样地相互取代。当血液中的氯离子浓度高时，能加速肺部二氧化碳的排出。氯也参与人体的酸碱平衡，也能对某些酶起激活作用，例如胃蛋白酶。

除了以上的功能外，总的来说，氯并未构成生命体细胞或器官的某一部分，它也不直接参加生命结构物质和生命大分子的组成，它只是作为电解质组成的一部分参与生命活动，具有电化学平衡和信使的功能。它的作用要比钠的作用小得多。

植物对氯的需要量要比需要硫小，但却比任何一种微量元素的需求要大。植物光合作用中水的光解需要氯离子参加，而大多数植物均可从雨水或灌溉水中获得所需要的氯。氯有助于钾、钙、镁离子的运输，并通过帮助调节气孔而控制了水损失。

氯离子过多对很多作物有着不良的反应，如烟草施用大量含氯的肥料会降低其燃烧性，薯类作物会因此减少其淀粉的含量等。