第四节 核酸的理化性质

一、核酸的一般理化性质
1.核酸分子中有末端磷酸和许多连接核苷的磷酸残基,为多元酸,具有较强的酸性。
2.核酸分子中还有含氮碱基上的碱性基团,故为两性电解质,各种核酸分子大小及所带电荷不同,电泳和离子法来分离不同的核酸。
3.A260的应用:
(1)DNA或RNA的定量
(2)判断核酸样品的纯度
①DNA纯品:A260/A280≥1.8
②RNA纯品:A260/A280≥2.0
二、DNA的变性
1.定义:在某些理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的过程。变性并不涉及核苷酸共键(磷酸二脂键)的断裂。
2.方法:过量酸、碱、加热、变性试剂如尿素、酰胺以及某些有机溶剂如乙醇、丙酮等。
3.变性后其它理化性质变化:
DNA变性的本质是双链间氢键的断裂
变性引起紫外吸收值的改变
4.增色效应:DNA变性时其溶液A260增高的现象
5.Tm:变性是在一个相当窄的温度范围内完成,在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度温度称为DNA的解链温度,又称熔解温度,或熔点。
6.Tm值与下列因素有关:
(1)DNA的均一性:DNA的均一性较高,那么DNA链各部分的氢键断裂所需的能值较接近,Tm值范围较窄,所之亦然,由于可见Tm值可作为衡量DNA样品均一性的指标。
(2)C-G碱基对含量:G-C碱基对为3对氢键,而A-T碱基对只有2对氢键,所以破坏G-C间氢键较A-T间氢键需要更多的能量。因此Tm值大小与G+C含量成正比,也可通过Tm值推算出DNA碱基的百分组成。
(3)介质中离子强度:离子强度低,DNA的Tm值较低。
三、DNA的复性与分子杂交
1.DNA复性定义:在适当条件下,变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构象,这一现象称为复性。(1、足够的盐浓度——消除磷酸基的静电斥力,2、足够高的温度——破坏无规则的链内氢键)
2.热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,这一过程称为退火。
3.减色效应:DNA复性时,其溶液A260降低。
4.核酸分子杂交:在DNA变性后的复性过程中,如果将不同种类的DNA单链分子或RNA分子放在同一溶液中,只要两种单链分子之间存在着一定程度的碱基配对关系,在适宜的条件(温度及离子强度)下,就可以在不同的分子间形成杂化双链。
5.这种杂化双链可以在不同的DNA与DNA之间形成,也可以在DNA和RNA分子间或者RNA与RNA分子间形成,这种现象称为核酸分子杂交。
6.核酸分子杂交的应用
(1)研究DNA分子中某一种基因的位置
(2)定两种核酸分子间的序列相似性
(3)检测某些专一序列在待检样品中存在与否
(4)是基因芯片技术的基础