《黄帝内经·素问·阴阳应象大论》：“余闻上古圣人，论理人形，列别脏腑，端络经脉，会通六合，各从其经；气穴所发，各有处名；溪谷属骨，皆有所起。分部逆从，各有条理；四时阴阳，尽有经纪；外内之应，皆有表里”。《千金翼方》：“凡诸孔穴，名不徒设，皆有深意”，即每个腧穴的命名，都具有它的实际含义。

（一）根据所在部位命名

根据腧穴所在部位的解剖名称或内脏名称命名。如腕旁的腕骨、乳下的乳根、脊间的脊中以及肺俞、心俞、脾俞、肝俞等背俞穴。

（二）根据治疗作用命名

根据腧穴对某种病症的特殊治疗作用而命名的。如治疗目疾所用的睛明、光明，治疗水肿所用的水分、水道等。

（三）结合中医学理论命名

根据腧穴部位和治疗作用，并结合阴阳、脏腑、经脉、气血等中医学理论来命名。如三阴交、三阳络、阴陵泉、阳陵泉、百会、气海、血海、关元、承泣、承浆、阳溪、阳谷、魄户、神堂等。

（四）根据天体地貌命名

利用自然界中的地理名称来命名的。如带有山、丘、陵、墟、溪、谷、沟、泽、海、池、泉等字的腧穴。如陷谷、合谷、太溪、后溪、小海、少海、照海等。

（五）参照动植物名称命名

根据动植物外形或名称来命名的。如犊鼻、鸠尾，攒竹等。

（六）借助建筑物名称命名

借用建筑物名称来命名的。如带有宫、阙、门、户、堂、室、关、枢、府、庭、房、窗、仓、舍、井等字的腧穴，用以比喻腧穴的所在部位或作用特点。如：神阙、印堂、志室、气户、库房、膺窗等。