朱棣登上帝位，表面上要恢复旧制，相关的措施也不少。之所以要恢复旧制，是因为“靖难”的旗号就是要保护和延续朱元璋所设的祖制。胜利之后不恢复祖制，则所谓的“靖难”则师出无名了。例如，朱棣登基之后，吏部奉命将大量官职重新改回为太祖洪武时期的官名，其职官的额数设计也全恢复旧制。当时的吏部尚书蹇义就留下了一部详细的奉诏恢复洪武旧制而上呈的造册文书——《吏部四司条例》，详细记载如何把建文朝官守恢复到洪武时代的模样。然而，另一方面，事实证明，恢复祖制只是朱棣打出的旗号，他在胜利之后的治国行政，其实与太祖的国策越行越远。

这样说不是要指责朱棣。与其说祖制是要求人们世代遵循，倒不如说祖制终归会被突破，因为任何一种制度都不会适应任何时代。从洪武朝到永乐朝，明代的政治制度发生了根本性的改变。