自身免疫与自身免疫病是两个易混淆的概念，自身免疫是生理性应答的保护作用，而自身免疫病是病理性应答的损伤作用。免疫应答的机制及后果在前面章节已经学过，所以学生首先需要厘清这两个概念。因此，翻转课堂自讲展示第一个问题就是什么是自身免疫？什么是自身免疫病？

自身免疫病的发病是由于某些内因和外因诱发下，自身免疫耐受状态被打破，持续迁延的自身免疫对自身抗原产生异常的免疫应答，造成了自身细胞破坏组织损伤或功能异常。其根本原因在于自身免疫耐受状态被打破，而自身耐受在基础理论部分已经学过，所以，第二问题就是自身免疫病的诱发因素是什么？

自身免疫病发病后是如何损伤机体的？其损伤机制就是II、III、IV型超敏反应的机理，而超敏反应是上次课的内容，学生已经学习过了。接下来要做的就是让学生以“超敏反应”这个旧知为支架来学习自身免疫病这个新知：常见的自身免疫病究竟是由什么诱因引发了什么损伤机制。因此，第三个问题就是常见自身免疫病的损伤机制是什么？

自身免疫维持中有一种非常重要的细胞-调节性T细胞（Treg），其发现过程经历了一段漫长的科研探索。第四个问题就是调节性T细胞是如何被发现的？其发现过程体现了怎样的科研精神？

自身免疫病的发病可以由自身抗原发生改变后成为“非己”抗原而引起免疫应答最终造成组织损伤。第五个问题就是联系生活实际，谈谈自身抗原到“非己” 抗原（改变了的自身抗原）的转变对你有什么启发。