就在隋朝平复了北部边患，开始进入发展时期以后，皇帝的后院再起风波，这个事情的起因要从太子杨勇被废为庶人开始。

杨坚与皇后独孤氏共有五个儿子，即太子杨勇、晋王杨广、秦王杨俊、蜀王杨秀和汉王杨谅。

杨勇是隋文帝的长子，他非常好学，喜欢辞赋。在北周时，曾任洛州总管、上柱国、大司马，统领禁卫。隋朝建国后，杨勇作为长子，顺理成章被立为太子。

但是，杨勇的性格有一个弱点，他喜欢奢华，还豢养了很多内宠。他的所作所为，与他母亲独孤氏一向崇尚简朴的个性发生了冲突，导致母亲独孤氏开始对他产生了反感，再加上弟弟杨广经常在父母面前告杨勇的状，杨勇渐渐被父母疏远，最后，随着猜忌加深，杨勇被废为庶人，改立杨广为太子。

仁寿四年（604），杨广害死了父亲隋文帝，继承了皇帝位。

杨广即位后，杨勇被赐一死，死后被追封为房陵王。杨勇的死，引起了其他人的不安，汉王杨谅是隋文帝的第五个儿子，在隋文帝生前，他曾任并州总管，统领西起太行山、东至渤海、北达燕门关、南距黄河的五十二个州，具有很强的实力。

杨广扳倒了太子杨勇、被立为太子之后，汉王杨谅心里就不服气。父亲隋文帝死后，杨广继位，眼看大哥被杨广赐死，杨谅开始感到不安，他深知二哥杨广心狠手辣，与其坐以待毙，不如起兵反抗。

杨谅起兵之后，出师不利，节节败退。隋炀帝采纳了杨素的推荐，起用以前的江州刺史李子雄为上大将军，并以长孙晟为相州刺史，征集山东兵，与李子雄共同配合镇压杨谅的军队。

由于长孙晟的儿子长孙行布在杨谅部下，所以长孙晟推辞说：“我儿子行布，今在逆地，如果我接受这个重任，我感到很不安。”

隋炀帝说：“你是一个勤奋而诚实的人，朕是知道的，今天相州这个地方，本来是齐国之地，人心浮躁，很容易被鼓动起来，如果这个地方出现了变故，就会助长敌人的势力，所以我想要把这个地方管理好，这个人非你莫属，这也是我使用你的原因，希望你不要推辞。”长孙晟听了隋炀帝的话之后奉命出兵，结果攻破了杨谅的军队，回军后转为武卫将军。

大业三年（607），炀帝想要到北部去巡视榆林，还要到塞外去炫耀武力。但是，他也怕启民可汗因为惊惧而造成叛乱，于是，先派长孙晟到启民可汗部宣旨。

启民可汗听说之后，便召集部落首领一起来接圣旨，长孙晟见这个地方杂草丛生，想要命令启民可汗亲自除草，并且让各个部落的酋长都看到，可汗对皇帝的敬重和畏惧。但是，长孙晟并没有直接说出来，他用手指着大帐前的杂草说：“这种草的根非常香。”

启民可汗听了，很奇怪地说：“这个草并不香啊。”

长孙晟又说：“天子马上就要来到这里，诸侯都亲自洒扫，除掉路边的杂草，来表示对皇帝的忠诚之心，现在我看到您这里杂草丛生，想必一定是非常香的草了！”

启民可汗这才领悟到长孙晟话里的暗示，他急忙说：“这是我的罪过，我的骨肉都是天子所赐，为天子效力，怎么敢推辞呢？”说完，可汗拔出佩刀，亲自除草。各个部落的酋长见状，也争相效仿。

启民可汗又下达命令，举一国之力修御道，西起榆林，东达蓟县，修成了一条长三千里、宽百步的御道。隋炀帝听到此事，非常高兴，任命长孙晟为右骁卫将军。

大业五年（609），长孙晟去世，时年五十八岁。在他的一生中，同突厥交往长达二十多年，虽然没有亲自指挥过重大的战役，但他凭着出众的谋略，为分化瓦解突厥、保持隋北境安宁、促进民族融合做出了重大贡献。