尼赫鲁去世后，新总理的人选主要在夏斯特里和德赛之间抉择。以卡马拉季为首的辛迪加派紧张而高效地为夏斯特里的出任铺平了道路。他们说服了诸多持不同看法的议员，甚至迫使德赛放弃了竞选。这样，夏斯特里就被国大党议会党团一致推举为党团领袖，1964年6月9日经总统任命，成为印度第二任总理。

拉尔·巴哈杜尔·夏斯特里（1904—1966）1904年10月2日生于贝拿勒斯，出自下级种姓家庭。幼时父亲去世，贫寒的生活锤炼了他的意志，养成了平易近人，善于协调的能力。尽管夏斯特里身高仅一米五，但他在民族解放运动中，却是一位顶天立地的坚毅的斗士。16岁时，他毅然辍学，投身国大党领导的抵制运动。此后，他为民族解放运动六次入狱。夏斯特里深得尼赫鲁赏识，逐步走上领导岗位。独立后，他担任国大党的秘书。入阁后，先后担任铁道部、交通运输部、工商业部、内务部和不管部的部长。

夏斯特里政府基本上继续尼赫鲁的政策。他保留了前内阁大多数成员，也将辛迪加派的成员吸收入阁。同时他很有策略地对待尼赫鲁家族成员，邀请英迪拉·甘地担当新闻部长，并且在内阁中排位第四，仅次于担任内政、国防和财政部长的老资格的国大党人。又请尼赫鲁的妹妹潘迪特夫人作为自己的特使，多次出国与联邦德国的阿登纳、法国的戴高乐等各国政要会谈。

在夏斯特里短暂执政时期，国内较为棘手的一起事件，是1965年1月在马德拉斯发生的“语言骚乱”。据印度宪法修正案规定，1965年1月26日是印地语定格为唯一官方语言、并取消英语同样享有这特殊地位的最后期限。南印度非印地语民族对此反应强烈，他们认为印地语是北方的语言，将它定为唯一官方语，实际是提升北印度而贬抑南印度。他们以马德拉斯为中心，用各种方式、甚至暴力方式进行了抵制。他们举行集会、游行，将一些印地语标牌砸碎或涂上黑油漆，甚至有两名抗议者当众自焚，被激怒的群众捣毁政府机关，破坏交通，与军警对抗，发生多次流血冲突。两名南方出生的中央部长也提出辞呈，抗议政府的语言政策。南印度的政党德拉维达进步联盟在抵制印地语为国语的运动中，表现得更为激进。它声称，如果确定印地语为唯一官方语言，泰米尔纳杜邦将宣布自治，这甚至威胁到了国家的统一。英·甘地曾亲临动乱重灾区，并显示出处理和调解严峻事件的才能。最后，夏斯特里政府在全印广播电台宣布五项决定：各邦均有权选择自己邦的语言；邦与邦之间的交流可使用英语或附有英语译文；非印地语的邦可用英语与中央政府进行正式交流，传递信息；中央政府机关继续使用英语；全国文官考试使用英语。在政府的承诺下，动乱才慢慢平息。

在对外关系上，印巴第二次战争无疑是夏斯特里倾心倾力的头等大事。1964年12月，印度政府正式宣布克什米尔地区为印度的一个邦，巴基斯坦和克什米尔的部分民众表示了强烈反对，双方的关系再次紧张起来。1965年2月两国就库奇兰恩地区的归属问题产生纠纷，逐渐演变成武装冲突。8月印巴在克什米尔争议地区交火，巴基斯坦军占得上风。印度军部及时改变战略，另遣军队越过印巴国境线对信德省发动进攻，克什米尔地区的局部冲突升级为印巴两国间的战争。战场上双方互有胜负，战局处于僵持状态。在英国政府斡旋和联合国的调停下，双方于1965年9月23日停火。随后由苏联出面邀请及安排下，夏斯特里与巴基斯坦总统阿尤布·汗在苏联的塔什干进行和谈。1966年1月10日，印巴双方发表了《塔什干宣言》，共同承诺两国军队在1966年2月25日前从对方领土上撤出，退回战前位置；遵守克什米尔停火线；遣返战俘；以和平手段解决争端；两国恢复全面外交关系。克什米尔争端仍悬而未决，双方只是阐述了各自的立场。

就在协定签署几小时后，夏斯特里突发心脏病，1月11日在塔什干去世。