科研工作者在从事论文撰写、项目申请及专利申报等科研工作时，常常会搜集大量的文献，而现代科技信息资源大数据时代的到来，增加了文献收集、整理、查阅及参考文献管理的难度。以前完全依靠依人工编辑管理文献(例如参考文献的插入和整理)，这种方式低效、烦琐，往往会占用科研人员的精力和时间。科研工作者迫切需要一种工具管理各种文献资源，于是文献管理软件应运而生。文献管理软件又叫书目管理软件，它是一种具有文献检索与整理、引文标注、按格式要求生成参考文献列表等强大功能的软件，可嵌入文字处理软件中使用，还可以直接通过在线数据库下载文献题录并对其进行统计分析。

文献管理软件的开发最早始于20世纪80年代初期，是由美国的Niles和Associates公司率先推出基于苹果电脑Macintosh的参考文献邮件定制服务，此为个人文献管理工具的雏形。1991年，Niles公司发布首款基于苹果个人电脑的桌面文献管理软件EndNote，目前该软件已经更新到X7版。国内对文献管理软件的研发始于2004年，是由北京金叶天翔科技有限公司开发的医学文献王，它是国内第一款医学个人文献管理软件。2005年，北京爱琴海软件公司开发的NoteExpress文献检索与管理系统成为目前国内最知名、使用用户最多的文献管理软件。文献管理软件从诞生到繁荣，历经了二十多年的市场竞争与淘汰，现存的知名品牌仍有十几种，国外软件有EndNote、Reference Manager、Pro Cite、Ref-Works、Biblioscape、Zotero、Mendeley等;国产软件如NoteExpress、Power Ref、Note First、医学文献王、E-study等。我们选择国内外比较知名、功能比较强大、具有代表性、实用频率比较高的两款文献管理工具进行具体介绍。