春二月間，太平天國侵揚州，揚州告警。時徐鴻謨方奉檄至袁浦(今江蘇淮安)，鄭蘭孫從孫太孺人挈子女倉皇出避，棄《都梁香閣集》、《蓮因室稿》兩集，惟奉清帝賜文、穆詩卷及其家乘，與先代遺像。避兵時，女徐雲芝及其從兄走失，後竟復得。是年冬暫居小紀(今揚州江都)，作《放歌》、《癸丑二月揚城告警，予倉皇奉姑慈出避，感而賦此》等。是年，子竺弟殉難，作《六月十二日哭子竺弟殉難》。

鄭蘭孫《癸丑二月揚城告警，予倉皇奉姑慈出避，感而賦此》其二:“承歡何以慰姑慈，歷盡艱辛到此時。一卷遺容重香火，四齡幼子念宗支。畫眉人遠書難寄，白髮秋生感可知。尤望天公黯呵護，奎章家乘莫相離。”^[143]末句自注:“予出避時行篋皆棄去，惟奉高廟賜先相國詩卷及先人遺像、家乘，敬不敢失。”^[144]俞樾《鄭孺人傳》:“咸豐三年，賊陷江寧，順流而下，將薄揚州。時徐君奉檄乞援於淮。孺人曰:‘事急矣!吾姑高年，不宜久居危城。’而又懼中途遇鈔掠，乃盡棄其囊匧，惟奉純皇帝賜文穆詩卷及其家乘，與先代遺像，從孫太孺人挈子女以出，奔如皋。”^[145]又俞樾《杉泉公配孫太宜人墓表》:“咸豐三年，粵賊攻揚州，若洲君方奉檄至袁浦。其配鄭太宜人請太宜人出避之。太宜人曰:‘吾守此待二兒歸耳，何避爲?’鄭太宜人因固請，乃遷居如皋。……鄭太宜人於筐箱囊橐，皆棄不顧，惟奉高廟賜文敬公詩卷及先世畫像與家乘以行，道途跋涉，風雨霑濡，詩卷畫像均幸無恙。家乘則稍損焉，太宜人手自補葺之。今武林徐氏猶得以考訂世系，敘次昭穆，賴有此冊之存，兩太宜人之力也。”^[146]據以上兩條，則此時徐鴻謨正在袁江奉檄乞援，揚州兵亂之時，鄭蘭孫以一女子而攜孫太宜人、子女避難，惟奉清帝所賜文穆詩卷、家譜及先代遺像，而捨棄自身詩詞稿，最終使徐氏家譜得以保存下來。

又，徐琪《欽旌先姊袁宜人刲臂孝行恭紀》詳細追述了其家避難過程:“我生四齡前，其事多不記。溯余五齡時，實維癸丑歲。吾父呂東公，僑居邗江地。吾母鄭恭人，慈姑日隨侍。吾與姊俱幼，繞膝競嬉戲。未幾烽煙警，倉皇驟出避。姊偕余從兄，相失在途次。母攜余後行，尚兼一幼弟。弟弱艱跋涉，悲哉遽折翅(胞弟璠以幼行維艱，遂落後殉寇難矣)。吾母慎宗祧，艱危籌百計。日履荆榛叢，饔飧每不繼。周遭歷十月，始與慈姑會(先世母張宜人奉先王母孫太恭人出避，先母携琪後行，亦相失輾轉，避匿民間者，十月辛苦備嘗)。其時我世母，嗟余從兄事。日夕聲悲啼，吾父亦隕涕。大書懸上賞，得者酬以幣。書不及吾姊，磊落十數字。不圖一旦間，吾姊亦俱至。僉謂丙吉家，陰德綿累祀。不然求大郎，何來女公子。時姊方十齡，天性已肫摯。雙手牽母衣，淚下巾爲漬。旁觀動驚歎，咄咄各稱異。”^[147]由詩及詩注可知，鄭蘭孫嫂張宜人奉孫太宜人一道，女徐雲芝與其從兄一道，鄭蘭孫携徐琪及幼子徐璠一道，途中輾轉相失、備嘗艱辛，至重新會合，共歷時十個月。徐雲芝與其從兄曾中途走失，徐鴻謨後懸幣求其兄子，徐雲芝及其從兄後終行至。另，知鄭蘭孫另有一幼子，徐璠，在逃難途中殉難。按:徐琪於咸豐元年(1851)十二月二十九日出生，推算其幼弟應於咸豐二年(1852)末或咸豐三年(1853)初出生。

鄭蘭孫《如皋寓齋感懷》:“依稀風景又他鄉，回望邗江黯自傷。小紀寒宵支病榻，如皋春日卸行裝。”^[148]“小紀”句自注:“去冬揚城寇亂，侍子避兵寄寓小紀，驚憂所致，病幾殆。”^[149]詩以“邗江”代稱揚州，揚州遭受太平天國之亂，時在咸豐癸丑(1853)。據小注中記載，其家於1853年冬先從揚州避居小紀。小紀，今揚州市江都區小紀鎮，在泰州西北。

是年六月十二日，孫子竺於揚州之亂中殉難，作《六月十二日哭子竺弟殉難》。

《續纂揚州府志》:“咸豐三年春二月，粵賊林鳳祥等，率衆陷揚州、儀徵。……粵賊洪秀全既陷金陵，與楊秀清計遣偽丞相林鳳祥、羅大綱、李開芳、曾立昌等率賊東下，時鎮江已陷，二十日陷儀徵，二十三日遂陷揚州。”^[150]