从《上博声系》的书名，我们不难看出该书的体例一改按《说文》部首编排古文字字编的惯例，而是用声韵来编排的。这和何琳仪师的《战国古文字字典——战国文字声系》、黄德宽先生等著的《古文字谱系疏证》体例大致相同。正如何琳仪师在《战国古文字字典·序言》中所言“声系系联法最明显的优长，则是有利于文字的形体比较。比较法是考释古文字的核心，一般说来，相同时代的横向比较往往比不同时代的纵向比较更为精确。声系系联为战国文字的横向比较提供了更为广泛的比较对象。”《上博声系》以韵部为经，以声纽为纬，以声首为纲，以谐声为目，排列上博楚简字形。其韵部一改何师所用的王念孙晚年二十二部说，采用目前通行的王力先生三十部说，方便查找；其声纽采用《战国古文字字典——战国文字声系》6类19纽说，即黄侃十九纽。同一韵部之声首或归并，名“准声首”，共收录769个声首。同一声首所系谐声依形旁分类而排列，大致按“人”、“物”顺序排列。

《上博声系》这种科学合理的编排体例恰可与其他研究上博楚简的工具书合而观之，既有形旁的对比，又有声旁的比勘，这对研究者和初学者都是大有裨益的。