受正统儒学的影响，历史上对于诸子之学的重视程度始终不够。也正是这个原因，对诸子文献的搜集与整理一直处于一种似有若无的状态。

历史上最早整理先秦诸子著作的是西汉的刘向、刘歆父子。刘向奉汉成帝命负责校理群书，每一部书整理完毕，均有一篇序随书献上，后世习惯性地称为“书录”，这些序大多数都亡佚了，目前存世的有《管子序录》《晏子春秋序录》《荀子序录》《列子序录》等，但学界对这些序的真实性仍存在分歧。刘向殁后，他的儿子刘歆继续整理图书，在他父亲《七录》一书的基础上，编成《七略》一书，将全部文献分为六大类，其中专列诸子略。班固修《汉书》，立《艺文志》，删节刘歆《七略》，基本保留了刘歆原著的结构。尽管刘氏父子并非专门整理诸子著作，但他们将诸子类著作专列一类，足见其对子书的重视。刘氏父子的校书工作，可以看做是对先秦诸子著作的系统整理。

刘向、刘歆之后，许多诸子著作都有了定本，尽管受经学影响子书并非真正成为学者们的研究对象，但在读经之余人们也开始关注子书。南北朝时期梁朝的庾仲容编有《子抄》一书，是对诸子著作的摘抄，这是目前所知最早的一部诸子著作的节选本，此书已经亡佚。唐代时尚有传本，马总曾将这部书删节而编有《意林》一书。

从唐代开始，对于先秦诸子的研究逐渐增多，唐初较为著名的是魏徵等人编纂的《群书治要》，尽管这部书并非专门的诸子研究著作，但其中也涉及许多诸子著作，从一个侧面反映了初唐时期子书的面貌。中唐时期，柳宗元有诸子辨，辨析先秦诸子的真伪问题，开后世辨伪学之先河。自此以后，对于先秦诸子的真伪问题，学术界一直都在争论。唐玄宗开元时期编纂了中国历史上第一部《道藏》，尤其是他将先秦道家诸子及其著作也纳入道教经典范围内，由此开启了道家研究的新篇章。唐代以后，历代皆有纂修《道藏》，根据陈国符先生《道藏源流考》一书的考证，历代《道藏》皆有先后承继关系。由现在存世的明代正统《道藏》我们可以知道，这部大型道教典籍丛书内所收的除道教经典之外，还收录了许多先秦诸子著作，也为我们保存了众多的子书文献。后世流传的子书版本，《道藏》本是无法跨越也是无法忽视的。这些书籍缘何混入这样一部道教丛书内，从何时起开始混入，目前还没有明确的研究。但从这样一个现象，我们可以知道，作为传统文化不可或缺的组成部分，先秦子书具有巨大的影响。

宋代开始，雕版印刷术发展，伴随着科举制的需要，子书的整理也成为当时学者的研究目标之一。现在存世的有许多宋版先秦诸子著作，可以想见当时诸子研究之盛。

自明代开始，学术思想进入综合期。八股文严重束缚了文人的思想，儒学开始走向没落。伴随着明代资本主义萌芽的产生，出现了一批活跃的思想家，他们开始主动吸收先秦诸子思想当中的有益成分，因此也带来的诸子学研究的新发展。在目前存世的诸子学研究著述中，以明代居多，如《诸子汇函》《诸子品节》《诸家俊语》《二十九子品汇释评》《子汇》等等。这些众多丛书的产生，带来了诸子学研究的兴起。

清代学术以乾嘉之学为主，乾嘉学者在治经之余也兼及诸子。这一时期众多的学者如黄丕烈、阮元、顾广圻、毕沅、惠栋、江藩、钱大昕等人，或致力于收藏子书，或以乾嘉学校勘诸子，由此也带来了子书整理的高潮。著名的如陈春的《湖海楼丛书》、蒋凤藻《铁华馆丛书》等，这些经乾嘉学者之手整理过的子书无论在刊刻还是校勘上，都足以成为历代子书文献中的善本。此外，这些学者还留下了很多校语和抄本文献，这些都是我们研究先秦子书的基础。

清末民国时期，尽管受到西学的冲击，中国的学术环境也开始发生巨变，但对子书的重视程度仍然持续着乾嘉学术以来的研究路子。首先出现的大型子书整理丛书是清光绪元年湖北崇文书局编纂的《子书百家》，收录自先秦以来诸子著作101种。民国时期，上海扫叶山房又编有《百子全书》，因其所选底本及校勘均不甚精审，也引起了学术界的诟病。光绪间，浙江书局还编有《二十二子》，收录先秦至魏晋时期子书二十二种，这部书因为底本及校勘都较为精审，在学术界影响较大。民国时期国学整理社编有《诸子集成》，收录先秦至汉魏时期译注或校本28种，本世纪初中华书局将其影印出版。这部书对学界影响也较大。后来，中华书局在此基础上又编有《新编诸子集成》，收书范围更广，内容也更丰富，是现在研究诸子学的必读书目。

近些年来，随着子学的逐渐兴起，越来越多的文献整理丛书不断问世。台湾学者严灵峰编著的《周秦汉魏诸子知见书目》以目录的形式系统整理了先秦至汉魏时期的子学著述，共收入道、儒、法、墨、名、兵等诸子63家，涉及相关文献数千种，是目前为止较为全面的系统梳理诸子著述的著作。此外，他还编有《无求备斋诸子集成》，选取老子、庄子、列子、论语、韩非子等历代传本或注本影印出版。这两部文献整理著作传入大陆后，在学术界影响很大。进入九十年代以后，国家开始逐渐重视古籍文献的价值。越来越多的古文献整理丛书或单部文献陆续被影印出版，同时各大公共图书馆也逐渐开放了古籍阅览的权限，为广大学者和古籍爱好者提供了很大的方便。

纵观自古以来的子书文献整理情况，从先秦诸子争鸣时代开始就有了对诸子思想及文献的整理，如孔子对古代文献的修订，庄子《天下》、韩非子《解老》《喻老》、荀子《非十二子》、吕不韦《吕氏春秋》、刘安《淮南子》等对诸子思想或文献资料的研究。随着子书的不断增多，学术研究的范围也越来越广。结合学术发展脉络，我们发现，每一次思想大变革的发生，都伴随着大量文献资料的问世。也正是这些文献资料的出现，才为学术思想的发展奠定了基础。