如果说艾滋病是起源于人类的近亲，即猿猴等灵长类动物，那么，对于人类自身而言，可能是自然界、动物界对人类的一个报复。现在，绝大多数科学家在艾滋病起源的问题上取得了共识。实验室检测表明，HIV-2存在于非洲，而且其更接近于一种猿身上的病毒，这种白脸猿的地理分布也与HIV-2的人群分布相一致，HIV -2对猿的家族可能不感染不致病，但人类则不堪HIV -2的一击。现在，HIV-2在中非、北美猖獗，20世纪80年代中期开始了欧洲、亚洲的致命远游。我国也出现了HIV -2毒株。另外，1990年，科学家在黑猩猩身上发现的病毒与HIV -1很相似，对所有的病毒用超级计算机进行分析发现，人类和猴子身上的病毒的祖先都源于非洲绿猴。

当今世界，科技与经济的发展，使科学家们更有能力来研究、追溯艾滋病的起源。实际上，除了新发现的艾滋病、克雅病等外，一些古老的传染病，如鼠疫、天花、霍乱、梅毒、麻疹等及很多的人畜、人兽共患的疾病，都起源于与人接触密切的动物。