暨南学堂位于南京鼓楼南侧，在现今鼓楼医院北墙外侧立有一块纪念石，标志着此处为暨南学堂的原址。

1907年春天，暨南学堂正式开课。不久爪哇又送来40多人，半年后新加坡送来50多人，学生人数突破100人。课程以国文与科学为主。不久，暨南学堂改制为暨南完全中学，开设小学、中学课程，以读经、历史、地理、国文为主，同时开设博物、物理、化学、法制、英文等课。（赵子云《难以忘怀的暨南学堂》）

1910年6月5日南洋劝业会在南京召开，劝业会上专门有暨南馆，陈列南洋华侨及南洋诸国送展的展品。暨南学堂不仅组织军乐队参加演出，还选送鳄鱼标本、铅笔画等展品参加陈列，受到好评。

辛亥革命后，因学校不少学生参加了武装起义及从事各项革命活动，学堂停办。1917年11月，北京政府委派黄炎培等筹措复校事宜，学堂于1918年3月恢复开办。同年春，暨南中学得以恢复，改为暨南学校，由赵正平任校长。