政策主体、客体与环境以及政策系统的各个子系统之间相互联系和相互作用，使得政策系统呈现为一个动态的运行过程。从系统论的观点看，政策系统的运行表现为一个系统的不断输入、转换和输出的过程。

政策系统的运行大致包括下列五个环节：

（1）政策制定——从发现问题到政策方案出台的一系列功能活动过程，包括建立议程、界定问题、设计方案、预测结果、比较与抉择方案和方案的合法化等环节。

（2）政策执行——政策方案付诸实践、解决实际政策问题的过程，也就是将政策理想变为政策现实的过程，包括组织和物质准备、政策分解、政策宣传、政策实验和指挥、沟通、协调等功能环节。

（3）政策评估——依据一定的标准和程序，对政策的效果作出判断，确定某项政策的效果、效益和优劣，并弄清该政策为什么能取得成功，或者为什么会导致失败。

（4）政策监控——为达到政策方案的预期目标，避免政策失误对政策过程尤其是执行阶段的监控，以保证政策的权威性和严肃性，包括监督、控制和调整等功能活动环节。

（5）政策终结——即在政策实施并加以认真评估之后，发现该政策的使命已经完成，成为多余的、不必要的或不起作用的，采用措施予以结束的过程或行为。