在哲学思想上，庄子继承并发展了老子“道法自然”的理论，使道家正式成为一个学派。庄子指出，“道”客观而真实地存在，“道”也是宇宙万物的本源。他认为“天”与“人”是两个相互对立的概念，“天”指自然，“人”指 “人为”的一切，二者相悖离。生硬地把“人、为”合二为一，得到“伪”字。故应顺应天道，抛弃“人为”，摒弃人性中“伪”的杂质，只留下清明。顺应天道而与天地相通，即为“德”。这是庄子一直倡导的。

庄子提倡“无为而治”。他认为“仁义”和“是非”是施加在人身上的刑罚，因此反对统治者的“仁义”和“法治”。不仅如此，他还批判社会中的权和势，认为“圣人不死，大盗不止”“窃钩者诛，窃国者为诸侯”，这些见解非常独特。至于人类怎样生存，他的观点是“天地与我并生，万物与我为一”，即享受自然，返璞归真。