目前，我国的渔业等水产行业的发展已经从过去的以“捕捞为主”向“养殖为主”的方向转变。我国变为世界水产大国，繁荣的水产养殖业固然为我国现代化建设和经济发展作出了巨大贡献，但是同时也对养殖水域的生物量以及我国诸多水生生物的生境等造成了严重危害，对许多珍稀物种亦造成了重大伤害。尽管亦有不少恢复措施正在进行当中，但是恢复的过程具有长期性，短期内我们很难对恢复的结果作出正确的评价。针对这种情况，我们应对其做出诸多反思。

（1）从国家层面上讲，需要在科学的研究基础上，对水产捕捞和水产养殖的规模与模式进行规范化操作，完善相关法律法规、提高公众思想意识。

（2）对于我国目前建设的防洪堤坝以及水电站等，应当借鉴国外的成功恢复经验，在设计时考虑对当地生物环境的影响，在科学实验的指导下，通过恢复措施的选择与实施将其对生物环境的影响降到最低，保护生物多样性以及生物量。

（3）应加强国际合作，提高经济区域以及国际间的海洋环境保护，保护长距离洄游鱼类的数量。

（4）工业生产污水及人类生活污水在排放过程中，应当有污水处理的环节，尽最大可能降低对水域环境的影响。

（5）针对通过牡蛎对长江河口水质进行恢复的想法，我们可以考虑在更多滨海区域通过贝类的投放来净化水质。同时利用贝类的碳汇作用，减少海洋酸化的危害。

（6）在未来，经济鱼、虾的养殖等可以参考海洋牧场计划，使管理更加规范化。