旧金山湾生态恢复的主要目标就是恢复海湾的生态健康以及水资源供应，具体可以细分为以下几个方面。

（一） 湿地恢复

海湾湿地恢复（图14-28）主要是保护、恢复原有湿地，并增加湿地、河岸和相关高地的面积；加强对海湾生境、季节性湿地、河湖和相关高地的管理；同时对恢复区进行监测与评估目的监测与评估，支持相关的研究，提高海湾生态系统的功能。

（二）生态系统恢复

海湾生态系统恢复是指提高水生生境以及陆地生境的质量，从而维护海湾及其三角洲的生态功能以支持海湾多样的动、植物种群及其可持续发展。

图14-28　旧金山湾湿地恢复地点（引自EcoAtlas（SFEI 1999））

（三）水质恢复

海湾水质恢复即提高整个流域的水质状况，为海湾居民提供清洁、可靠、经济上可以承受的饮用水，同时促进海湾及其三角洲生态系统的健康。

（四）淡水供给的调控

通过淡水供给的调控缓解三角洲水资源的供应不足和分配不合理的状况，更有效、灵活地利用水资源。