海草床有着不可替代的生态功能与巨大的经济价值。近年来由于自然与人为因素的影响，全球范围内海草床的面积已明显减少，应当加强对海草生态系统的调查、监测、评估、研究，以适应海草生态系统的保护、管理、恢复、重建和可持续发展的要求。

（一）监测方法和行动

海草床生态监测不仅旨在探讨海草资源本身的现状与发展趋势，更可用以评估所在海区的近海生态环境质量，及时发现所存在的生态问题。

地面勘查和采样是一种经典监测方法，费时但是准确，所以大多数海草监测计划仍采用样方和样带。近20年来，海草监测技术快速进步。研究者已经利用“3S技术”（遥感RS、地理信息系统GIS、全球定位系统GPS）在景观水平研究海草床的动态变化过程。遥感技术可以极大提高海草监测的空间广度，但遥感资料的连续性是最大难题。航空摄像和水下摄像也具有很大的发展潜力。

海草床监测指标可分为大型底栖生物、海草群落、栖息地、水环境与沉积物环境及人为干扰五大类。各大类又包含不同的指标：①大型底栖生物：生物量、种类、覆盖度；②海草群落：生物量、种类、覆盖度（海草、大型藻类、附生植物）、直立枝密度、地上部分长度及有性生殖现状等；③栖息地：海草面积和分布；④ 水环境与沉积物环境：水体盐度与温度、沉积物温度；⑤ 人为干扰：滩涂养殖面积比例、挖掘星虫与贝类的人数和强度。与红树林、珊瑚礁等滨海湿地生态系统不同的是，由于构成海草床的主体植物是一年生和多年生的草本植物，不同季度间甚至不同月份的海草床群落变动较大，因此，除大型底栖动物的调查频率可以为一年两次（分别在春、秋两季进行）外，其余的监测项目调查频率为一年至少四次，即至少在春、夏、秋、冬四季各开展一次。不同年份同一季节的监测时间应尽可能固定，时间变动最多不超过20天（邱广龙等，2013）。

目前，海草普查（seagrass watch）和全球海草监测网（seagrass net）是最大的海草床监测行动。由世界海草协会（World Seagrass Association）组织的全球海草监测网，始于2001年，目前已有近30个国家参与。2008年9月，我国内地第一个分站在北海建成。它是用标准的方法调查各地海草资源的现状和面临的威胁，提高对海草生态系统的科学认知和公众参与意识。海草普查行动由澳大利亚政府资助，对本国海草床实施长期全面监测，对越南、新加坡及马来西亚等环南中国海周边国家的海草调查进行相关指导。

（二）保护和管理措施

改善水质、增加水体透明度是保护和恢复海草资源最直接的方法，因此要减少海草床周围污染物的排放和氮的输入量。近年来，国内外对海草移植方法、种子播种法、成活率影响因素等进行了研究，证明了人工移植海草和播种可弥补由自然和人为原因导致的损失。此外，还可通过红树林和沼泽对污染物的过滤作用间接保护海草床。增加对海草有益的生物, 控制有害生物（如病害生物和入侵生物）的措施也非常重要。

政府在海草床管理中应发挥引导作用。我国1994年4月1日起实施的国家标准“海洋自然保护区类型与级别划分原则”，划分海洋自然保护区为3大类别16个类型，“海草床”为海洋与海岸自然生态系统的10种类型之一。国家海洋局2002年4月发布的《海洋自然保护区监测技术规程——总则》列出了海草床生态系统监测的主要指标为海草床植物覆盖度、厚度、种类，底栖动物种类多样性、群落结构。国家海洋局2005年5月发布了《近岸海洋生态健康评价》，其中海草床生态系统健康状况评价指标包括水环境、沉积环境、生物残毒状况、栖息地、生物指标（吴瑞和王道儒，2013）。