海洋与陆地一样，在人类的开发热潮中，海洋生态环境也受到了严重的伤害。海洋生态系统受损害，突出表现在生境受损、典型海洋生态系统退化、海洋生态灾害频发以及海洋生物资源过度开发与利用等方面。

正如2011年联合国在里约热内卢召开的可持续发展会议（United Nations Conference on Sustainable Development）发表的文件所指出：近几十年海洋经济的快速增长，主要是通过对海洋非可持续开发的途径获得的；据统计，全球海洋至少有40%的海域受到人类的严重影响，主要海洋生态系统的60%已经退化或正在以不可持续的方式被使用，造成了巨大的经济和社会损失。

海洋污染、过度捕捞以及大规模开发，是导致海洋和河口生态系统受损的主要因素。海洋生态系统退化，主要表现在以下诸方面。